加载中…
个人资料
zinky
zinky
  • 博客等级:
  • 博客积分:0
  • 博客访问:3,573
  • 关注人气:1
  • 获赠金笔:0支
  • 赠出金笔:0支
  • 荣誉徽章:
访客
加载中…
好友
加载中…
评论
加载中…
留言
加载中…
博文
标签:

linux

server

分类: computerScience
报错内容:
/sbin/mount.ntfs: symbol lookup error: /sbin/mount.ntfs: undefined symbol:
ntfs_xattr_build_mapping


解决方案
mv /lib/libntfs-3g.so.87 /lib/libntfs-3g.so.87.unwanted
ldd $(which ntfs-3g)

原理
fedora升级 : ntfs-3g-2016.2.22-3.fc25.x86_64.rpm 通过--enable-xattr-mappings 编译。链接库应该是 /lib64/libntfs-3g.so.87, 而不是 /lib/libntfs-3g.so.87 ,系统很有可能安装了两个库,引起冲突。对原油的苦重命名即可


阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
标签:

r

linux

分类: bioinformatics
knitr默认调用X11设备对rmd文件内部的作图函数进行绘制,那么我们在服务器后台操作的时候需要声明采用cairoPNG来绘图,确认你的cairo可用的前提下,在rmd文件中添加以下chunk
```{r setup,include=FALSE, echo=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(dev='CairoPNG', fig.width=9, fig.height=9, dpi = 72)
```
问题解决

阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
标签:

shiny

r

linux

server

分类: computerScience
把shiny架在服务器上访问起来比较方便,之前装过几次,最近重装,有必要把安装的过程重温一遍,写下此blog方便以后再用:
shiny是干什么的这里就不提了,去Rstudio上看
首先第一个问题,安装在服务器上需要root权限么?
其实怎么说呢,我装过root的也装过非root的,如果你有root,安装比较方便,几句命令就ok了,如果么有root,有个sodu权限也可以;最后一种就是即没root也没sudo,这个也可以安装,但是安装起来挺麻烦,shiny的官网有教程,可以参考这个一步步来https://github.com/Cambridge-R-User-Group/CambRweb/wiki/Shiny-Server-tutorial
实践证明,这个是行的通的,至少我装成功了

安装步骤
下载R 建议你重新编译
我之前服务器上装有R ,但是在用shiny画图的时候无法生成图形,提示X11 的问题,这个可以参考我之前的blog
我用的fedora ,安装命令很简单
sudo yum install R
安装好以后
阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
标签:

r

分类: Biology
一句命令不解释
labs(colour = legendInput())
阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
(2014-06-06 15:04)
标签:

it

linux

分类: computerScience

转自http://blog.csdn.net/oyylgh/article/details/8235173#userconsent#

不知道好用不 转载备份下

简介

作为一个多用户、多任务的操作系统,Linux下的文件一旦被删除,是难以恢复的。尽管删除命令只是在文件节点中作删除标记,并不真正清除文件内容,但是其他用户和一些有写盘动作的进程会很快覆盖这些数据。不过,对于家庭单机使用的Linux,或者误删文件后及时补救,还是可以恢复的。

阅读  ┆ 转载 ┆ 收藏 
标签:

linux

mount

开机挂载

it

分类: computerScience
命令df可以直接查看安装盘的文件系统类型,加了-h以后可以将大小单位转换方便查看
阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
因为早期用的是fedora16,更改防火墙的命令一直是
 systemctl disable iptables 
systemctl stop iptables
或者是
 systemctl status iptables
重装了fedora20以后发现

崩溃呀。

看了官方的文档才发现,自己太天真了,fedora18以后,防火墙命令已经改了。。。
关闭防火墙
 systemctl disable firewalld 
systemctl stop firewalld

查看状态
systemctl status firewalld


果断这时候还是要看文档啊
看下面连接
http://fedoraproject.org/wiki/FirewallD/zh-cn fedora官方wiki

粘贴部分重要的用法

使用 firewall-cmd

命令行工具 firewall-cmd 支持全部防火墙特性。对于状态和查询模式,命令只返回状态,没有其他输出。

一般应用

  • 获取 firewalld 状态
阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
标签:

netbeans

fat-jar

it

分类: computerScience
我的另外一个blog
过来看
http://blog.csdn.net/likelet/article/details/25895209 
阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
(2014-04-16 16:50)
标签:

ggplot

r

shiny

plot

rchart

分类: bioinformatics
R下的rChart包安装比较蛋疼
依赖多个包
 deps = c('RCurl', 'RJSONIO', 'whisker', 'yaml','httpuv') for (dep in deps){   install.packages(dep) }
该命令安装所需的依赖包

下载rChart包
https://github.com/ramnathv/rCharts/archive/master.tar.gz
安装
install.packages(path/to/tar/file, repos = NULL, type='source')
install.packages('~/rchart.tar.gz', repos = NULL, type = 'source')
Installing package into 鈥home/shiny/R/x86_64-unknown-linux-gnu-library/3.0鈥
(as 鈥榣ib鈥is unspecified)
Warning in untar2(tarfile, files, list, exdir, restore_times) :
  skipping pax global extended headers
* installing *source
阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
标签:

r

shiny

ggplot

分类: bioinformatics
采用Shiny开发R的Web app,界面美观大方,然而在代码调试过程中着实让人蛋疼不已:
今天在sever.r中写到以下代码(在线画PCA图的工具):
 output$plotPCAtwoDtext <- renderPlot({
     a<-datasetInput()
     pca <-PCA(a[,2:ncol(a)], scale.unit=T, graph=F)
     PC1 <- pca$ind$coord[,1]
     PC2 <- pca$ind$coord[,2]
     plotdata <- data.frame(group=a[,1],PC1,PC2)
     plotdata$group <- factor(plotdata$group)
     plot <- ggplot(plotdata, aes(PC1, PC2)) +
          geom_point(aes(colour = group,shape = group),size = input$pointSize) +
          geom_text(aes(label=rownames(plotdata)), size=5, hjust=0.5, vjust=-0.5)+ 
        &nbs
阅读  ┆ 评论  ┆ 转载 ┆ 收藏 
  

新浪BLOG意见反馈留言板 不良信息反馈 电话:4006900000 提示音后按1键(按当地市话标准计费) 欢迎批评指正

新浪简介 | About Sina | 广告服务 | 联系我们 | 招聘信息 | 网站律师 | SINA English | 会员注册 | 产品答疑

新浪公司 版权所有