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杂谈 |
主要内容
• 什么是EST?
• EST的应用
• EST序列测定及分析过程
• 实例:家猪脑组织EST分析
ESTs的来源
上世纪80年代,对cDNA序列进行大规模测序的想法就曾提出,但对此一直存在争论,有人认为这种方法能发现成千上万的新基因;而反对者则认为cDNA序列缺少重要的基因调控区域的信息。90年代初Graig
Venter 提出了EST的概念,并测定了609条人脑组织的EST,宣布了cDNA大规模测序的时代的开始 (Adams et al.,
1991)。
http://www.bbioo.com/bio101/UploadFiles/200712/20071222145046780.jpg
● 93年前ESTs数据收录于GenBank, EBI和DDBJ。
● 1993年NCBI(National Center of Biotechnology
Information)建立了一个专门的EST数据库dbEST来保存和收集所有的EST数据。
什么是 ESTs ?
ESTs(Expressed Sequence tags
)是从已建好的cDNA库中随机取出一个克隆,从5’末端或3’末端对插入的cDNA片段进行一轮单向自动测序,