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monboqm |
分类: Gaussian |
| 分类: Gaussian |
仅做参考
非双杂化泛函的最佳选择:
计算碳团簇用B3LYP
计算硼团簇用TPSSh
计算双核金属用PBE、BP86,勿用杂化(see JCTC,8,908)
计算NMR用KT2,M06-L, VSXC, OPBE, PBE0
计算普通价层垂直激发用PBE0(误差约在0.25eV),M06-2X也凑合
计算电荷转移、里德堡垂直激发,以及各种绝热激发能用wB97XD、CAM-B3LYP、M06-2X
计算极化率、超极化率追求稳妥用PBE0,追求精度用CAM-B3LYP、HCTC(AC)
计算双光子吸收截面用CAM-B3LYP
计算ECD用B3LYP、PBE0
计算HOMO/LUMO gap用HSE、B3PW91(整体来说这个好,HSE的杂化参数有点依赖于体系)
计算热力学数据(含势垒)用M06-2X(加上DFT-D3(BJ)校正更好)
计算多参考态特征强的体系用M11-L
计算卤键:M06-2X
计算弱相互作用用wB97XD、M06-2X(加上DFT-D3(BJ)校正更好)。
很大体系弱相互作用用PBE-D2/TZVP+Counterpoise且包含DFT-D三体色散校正项
其它情况或模棱两可的时候用B3LYP(加上DFT-D3(BJ)校正更好)。允许更大计算量追求更可靠
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Developments and
applications of DFT
1.引言
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杂谈 |
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PBS(Portable Batch System)最初由NASA的Ames研究中心开发,主要为了提供一个能满足异构计算网络需要的软件包,用于灵活的批处理,特别是满足高性能计算的需 要,如集群系统、超级计算机和大规模并行系统。PBS的主要特点有:代码开放,免费获取;支持批处理、交互式作业和串行、多种并行作业,如MPI、 PVM、HPF、MPL;PBS是功能最为齐全, 历史最悠久, 支持最广泛的本地集群调度器之一。 PBS的目前包括openPBS, PBS Pro和Torque三个主要分支. 其中OpenPBS是最早的PBS系统, 目前已经没有太多后续开发,PBS pro是PBS的商业版本, 功能最为丰富. Torque是Clustering公司接过了OpenPBS, 并给与后续支持的一个开源版本.
PBS的应用不同于一般的直接运行:mpirun –np number ./executable_file
直接运行上句,则只能在单个节点上进行并行计算。如果要在多个节点上并行执行则要写machinefile或p4pgfile,两种文件的具体写法参考张林波等《并行计算导论》。运行命令分别为: