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博文
(2019-03-30 10:14)
标签:

p53

mrna

rna

核酸研究

基因表达

分类: 上海艾博思生物科技有限公司
聊聊p53 mRNA



本文从p53 mRNA角度介绍它的功能和调控作用的多样性。

应激反应调控p53 mRNA选择性翻译


图1:P53 mRNA选择性翻译

介绍两个知识点:同源异构体(isoform)和转录变
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lncrna

科研老司机

胚胎干细胞

分化

chip-seq

分类: ncRNA

科研老司机谈lncRNA案例分析:p53调控lncRNA“LncPRESS1”

导语

最新的《Molecular Cell》发表了Michelle C. Barton团队最新lncRNA研究成果。作者通过转录组筛选分化过程中的胚胎干细胞的lncRNA发现一个胚胎干细胞特异性的p53调控的lncRNA,命名为lncPRESS1,该lncRNA控制干细胞的命运。

《Molecular Cell》报道摘要

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dino

dna损伤

ko

p53

凋亡

分类: ncRNA

《Nat. Genet.》lncRNA DINO与DNA损伤

导语

最近,斯坦福大学的研究人员发现,被称为P53的肿瘤抑制基因,可通过一个叫做DINO的调控RNA分子而得以稳定。这种相互作用有助于细胞对DNA损伤做出反应,并可能在癌症的发展和过早老化中发挥作用。该研究结果发表在9月26日的《Nature Genetics》杂志上。

《Nature Genetics》摘要

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let-7

mirna

神经母细胞瘤

治疗

微小rna

分类: miRNA

《自然》最新研究:let-7家族与神经母细胞瘤

导语

来自波士顿儿童医院、德国科隆大学医院等机构的研究人员证实,在神经母细胞瘤中多种机制破坏了let-7 microRNA家族。这一重要的研究发现发布在7月6日的《自然》(Nature)杂志上。 

(2016-07-06 17:23)
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假基因

非编码rna

环状rna

疾病

核酸研究

分类: ncRNA

假基因和疾病

导语

假基因是一段具有与功能基因相似的DNA序列,但由于存在许多突变以致失去了原有的功能。过去的研究认为假基因是没有功能的DNA片段,是基因组进化过程中产生的噪音。然而,随着分子生物学技术的发展,越来越多的研究证明了假基因具有重要的生物学功能并且与疾病息息相关。

假基因的发现和简

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lncrna

dna编辑

rna编辑

c2c2

分类: ncRNA

C2c2:一种靶向RNA的新型CRISPR系统

ht

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clip

qrt-pcr

lncrna

蛋白核酸相互作用

非编码rna

分类: ncRNA
CLIP-qPCR分析lncRNA与RNA结合蛋白作用谱
哺乳动物细胞表达广泛的转录本,一些是编码蛋白的mRNA,还有大量的非编码RNA。长链非编码RNA作为大于200nt的非编码RNA能够调控蛋白的表达模式,调控方式包括基因转录,pre-mRNA剪接,mRNA输出,mRNA降解,蛋白翻译和蛋白的泛素化。越来越多共识表明lncRNA活跃的影响基因表达,增强了对lncRNA表达和调控的机制研究的兴趣。高通量的揭示lncRNA和RNA结合蛋白反应的方法大量被研发,然而最近开发的交联免疫共沉淀和qPCR分析CLIP-qPCR (cross-linking and immunoprecipitation followed by reverse transcription and quantitative PCR)能够鉴
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非编码rna

rna

双链结构

组图

xist

分类: ncRNA
 活细胞中的RNA双链图谱揭示出了高阶转录组结构
导语
RNA具有碱基互补配对的内在属性让其形成复杂的结构从而适用于多样的生物学功能。来自斯坦福大学、科罗拉多大学等机构的研究人员,开发出一项叫做PARIS的技术,通过该技术绘制活细胞中的RNA双链图谱揭示出了高阶转录组结构。研究人员通过在三种人类和小鼠细胞类型中进行PARIS分析,揭示出了转录组内的常见远程结构、高阶结构及RNA-RNA反式相互作用。PARIS在单分子水平上确定了碱基对互作,揭示了普遍的选择性构象。PARIS是一种通过确定螺旋的方法指导RNA结构分析,该方法对RNA结构组和RNA相互作用组研究提供了适用且灵活的方法。这一重要的研究成
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lncrna

干细胞

分化

研究进展

分类: ncRNA
反义 lncRNA顺式调控基因转录的新模式


3月17日,清华大学医学院沈晓骅课题组在《细胞干细胞》(Cell Stem Cell)在线发表了题为《反义长链非编码RNA调控基因表达和多能干细胞分化》的研究论文,系统揭示了长链非编码RNA顺式调控基因组上邻近基因的表达,以及它们在干细胞分化和发育中的作用。

  多细胞生物拥有不同大小的基因组,比如人的基因组比秀丽线虫的大30倍,它们却拥有相似数目的蛋白编码基因。蛋白分子一直被认为是生命活动的载体和执行
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问答

rna

什么是rna

crispr/cas9

中心法则

分类: RNA生物信息学
第一问:为什么研究RNA?
http://s16/bmiddle/002lWhsAgy6Xc9UKBYj9f&690


导语

核糖核酸(缩写为RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA中的T。

1.中心法则(Genetic Central Dogma)

http://s1/bmiddle/002lWhsAgy6Xc9X2TzW9
  

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