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分子动力学 |
分类： 分子模拟 |
使用acpype对UCSF
Chimera处理后结构进行计算，有时会出现Errno2，利用acpype -di
***.mol2
可以得到更详细的报错信息，如下：
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股票 |
分类： 分子模拟 |
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VMD的console是十分强大的，也提供了很多内置命令，这里把当年研究VMD内置命令的笔记的一小部分发上来。和user guide有相似之处，但是我都尽量写成例子的形式来说明，绝大部分都是亲自试过的。可能当时有些地方写的不准确，也不完整，但是现在也懒得check了。有疑问还是对照user guide中的严格说法。
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RNA干扰（RNAi），即用20
| 分类： 生化 |
二面角指两个半平面所夹的空间部分。
残基二面角包括主链二面角和侧链二面角。主链二面角包括phi、 psi、 omega
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