瑷珲历史陈列馆，是我国唯一一座全面反映中俄东部领土演变历史为基本陈列内容的专题性遗址博物馆。

基本陈列《瑷珲历史陈列》分为五个部分。

第一部分：黑龙江——中国北方民族的母亲河，展出黑龙江畔中国侧采集、出土的精美石器、辽金文物，汉魏时期的考古成果。

第二部分：十七世纪的中国黑龙江流域和中俄《尼布楚条约》，十七世纪四十年代开始，清政府统治下的黑龙江流域各族，遭受沙俄哥萨克的侵扰，清政府进行了雅克萨自卫反击站，通过谈判中俄签订了《尼布楚条约》。

第三部分：十七世纪末至十九世纪中叶的中国黑龙江流域，中俄《尼布楚条约》签订后，在约一个半世纪的和平环境里，瑷珲发展成为黑龙江中上游地区的中心城市。

第四部分：十九世纪下半叶的中国黑龙江流域和中俄《瑷珲条约》，十九世纪下半叶清政府由盛转衰，被迫与沙俄签订了《瑷珲条约》、《北京条约》，两个条约中国丧失了100余万平方公里的土地。

第五部分：庚子俄难和重建瑷珲，《瑷珲条约》的签订并没有满足沙俄对中国的贪欲，1900年制造了震惊世界的“黑龙江上的悲剧”，攻占我国东北。

常设魁星阁，就在瑷珲历史陈列馆外面的院子里，魁星阁历来就是人们登高望远的最佳去处，登上阁顶极目远眺，古城全貌、十里大江尽收眼底。魁星阁建于光绪十八年至二十六年，几经战火复建，现在的魁星阁看起来很新。