基于质体基因组序列变异位点的松科油杉属和冷杉属植物资源遗传多样性的分子鉴定新方法
(2024-09-04 11:08:57)分类: 科学探索 |
1 论文标题:基于质体基因组序列变异位点的松科油杉属和冷杉属植物资源遗传多样性的分子鉴定新方法
2 作者信息:刘美辰:北京市食品检验研究院(北京市食品安全监控和风险评估中心),北京;李
斌*:中国林业科学研究院林业研究所,北京;中国林业科学研究院林木遗传和育种国家重点实验室,北京;左云娟:中国科学院东南亚生物多样性研究中心,云南
西双版纳;中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心,云南西双版纳;靳晓白:国家植物园,北京;索志立*:中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,北京
3 出处和链接:刘美辰, 李斌, 左云娟, 靳晓白, 索志立.
基于质体基因组序列变异位点的松科油杉属和冷杉属植物资源遗传多样性的分子鉴定新方法[J]. 植物学研究, 2024, 13(4):
434-445. https://doi.org/10.12677/br.2024.134046
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摘要:物种多样性的精确鉴定是植物资源可持续利用的基础。油杉属和冷杉属是松科内的2个近缘的属。我们利用油杉属和冷杉属的种/变种的质体基因组序列中的物种特有的107个核苷酸变异位点作为分子性状首次编制分子鉴定检索表,供试样品得到成功鉴定。物种特有变异位点的数量和核苷酸构成存在种间差异。铁坚油杉(原变种)Keteleeria
davidiana (C.E. Bertrand) var. Davidiana
(44个)的特有变异位点的数量最多,随后依次是云南油杉Keteleeria evelyniana Mast.
(34)、库页冷杉Abies sachalinensis (F. Schmidt) Mast. (19)以及白叶冷杉Abies
veitchii Lindl. (10)。铁坚油杉(原变种)的特有变异位点中,T的比例(36.36%)最高,随后依次是A
(29.55%)、G (20.45%)和C
(13.64%),T的比例为C的比例的约2.6倍。云南油杉的特有变异位点中,A的比例(50.00%)最高,是T或C的比例(17.65%)的约2.8倍,是G的比例(14.71%)的约3.4倍。库页冷杉的特有变异位点中,C的比例(31.58%)最高,随后依次是T
(26.32%)、A (21.05%)和G
(21.05%),C的比例为A或G的比例的1.5倍。白叶冷杉的特有变异位点中,C的比例(30.00%)最高,是另外3种核苷酸(A、C或G)比例的1.5倍。结果显示,质体基因组的单核苷酸变异位点信息,可用于油杉属和冷杉属植物资源遗传多样性的分子鉴定。调查了中国过去120多年油杉属和冷杉属植物标本的收集现状,讨论了存在的问题和对策。本研究对于油杉属和冷杉属植物的分类修订、种质资源的保护和利用具有重要价值。
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