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基于函数型Cox比例风险模型的基因基因交互效应分析及在眼病中的应用

(2024-03-12 16:50:04)
分类: 期刊杂志
1 论文标题:基于函数型Cox比例风险模型的基因–基因交互效应分析及在眼病中的应用

2 作者信息:郭诗雨, 郑海涛*:西南交通大学数学学院统计系,四川 成都;李运明:西南交通大学数学学院统计系,四川 成都;西部战区总医院医疗保障中心,四川 成都

3 出处和链接:郭诗雨, 李运明, 郑海涛. 基于函数型Cox比例风险模型的基因–基因交互效应分析及在眼病中的应用[J]. 理论数学, 2024, 14(2): 817-827. https://doi.org/10.12677/PM.2024.142079

4 摘要:疾病关联性研究存在大量的基因与基因的交互效应(gene-gene interaction)和基因与环境因素的交互效应(gene-environment interaction)分析,以上交互效应对个体化诊疗具有极为重要的参考价值。针对基因与基因交互效应,本文提出了一种具有函数交互效应的Cox比例风险模型。该方法将基因的多个单核苷酸多态性(SNP)之间的交互效应进行函数化处理,大大降低了待估参数的维数。基因–基因的交互作用的假设检验采用似然比(LRT)检验统计量。经模拟研究表明,所提方法能够较好地控制第I类错误率,功效也比较高。实例分析表明,利用所提出的方法能够有效地检测出与老年黄斑变性和白内障(AREDS)相关联的基因–基因交互作用。

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