纳米氧化铈暴露下大型溞MAPK基因家族的表达分析
(2023-12-28 09:21:40)1 论文标题:纳米氧化铈暴露下大型溞MAPK基因家族的表达分析
2 作者信息:张园雯, 周 妍, 刘 琪, 康欣怡, 陈 晶, 魏
杰:大连海洋大学,辽宁省省级高校水生生物学重点实验室,辽宁 大连
3 出处和链接:张园雯, 周妍, 刘琪, 康欣怡, 陈晶, 魏杰. 纳米氧化铈暴露下大型溞MAPK基因家族的表达分析[J].
海洋科学前沿, 2023, 10(4): 306-318.
https://doi.org/10.12677/AMS.2023.104031
4 摘要:MAPK基因家族广泛参与生物体细胞内的各种生命过程,与生物对环境胁迫的应答相关。然而,在纳米氧化铈(Nano
cerium dioxide,
nCeO2)暴露下大型溞MAPK基因家族成员的作用机制还不清楚。本文利用BLAST、HMM和SMART等方法在大型溞基因组中鉴定MAPK基因家族成员,分析大型溞各个MAPK基因的理化性质、染色体定位、结构域、保守基序、系统发生关系等,并利用qPCR分析不同浓度、不同时间nCeO2暴露下各个MAPK基因家族成员的表达模式。结果鉴定出14个大型溞的MAPK基因,分布于8条染色体上。MAPK基因家族编码的蛋白质序列长度为361~1546
aa,分子量为38.93~77.02
kDa,等电点在5.3~9.51。12个MAPK蛋白具有S_TKc结构域,4个保守基序。系统发生分析显示,大型溞的14个MAPK基因分别属于4个亚家族,基因序列在进化过程中具有较高的保守性。在50和150
mg/L nCeO2暴露48
h后,大型溞的7个MAPK基因DmMAPK-p38b、DmMAPK4、DmMAP2K4、DmMAP3K4、DmMAP3K7、DmMAP3K11、DmMAP4K5的转录表达水平与对照组相比,极显著上调。结果提示,MAPK基因家族成员与大型溞对nCeO2的胁迫应答调控相关。本研究为评估纳米材料对水生生物的潜在毒性提供科学参考。
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