基于Wasserstein生成对抗网络和残差网络的8类蛋白质二级结构预测
(2023-08-17 08:59:46)1 论文标题:基于Wasserstein生成对抗网络和残差网络的8类蛋白质二级结构预测
2 作者信息:李 舜, 马玉明*, 刘毅慧*:齐鲁工业大学(山东省科学院)计算机科学与技术学院,山东 济南
3 出处和链接:李舜, 马玉明, 刘毅慧. 基于Wasserstein生成对抗网络和残差网络的8类蛋白质二级结构预测[J].
计算生物学, 2023, 13(1): 1-9.
https://doi.org/10.12677/HJCB.2023.131001
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摘要:蛋白质二级结构包含充分的蛋白质信息,而且蛋白质二级结构是研究蛋白质三级结构和药物设计的基础,因此,本文提出了一种基于Wasserstein生成对抗网络(WGAN)和残差网络(ResNet)的蛋白质8态二级结构预测的方法。该方法首先通过Wasserstein生成对抗网络(WGAN)提取蛋白质特征,将其与PSSM结合成新的特征集合,然后将新的特征集合输入到残差网络(ResNet)预测并得到最终结果。经过实验,该方法在测试集CASP10-14和CB513中的Q8预测准确率分别为73.21%,72.43%,71.67%,69.83%,70.17%和73.89%。通过实验表明,Wasserstein生成对抗网络(WGAN)具有出色的特征提取能力,ResNet能够有效地训练深层网络结构,从而提高蛋白质二级结构的预测精度。
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