新冠病毒Omicron变异株S蛋白变异位点及进化分析
(2023-03-22 09:02:30)1 论文标题:新冠病毒Omicron变异株S蛋白变异位点及进化分析
2 作者信息:吴秀兰, 黄万信, 钟华斌:肇庆学院食品与制药工程学院,广东 肇庆;李绮晴, 郑珊丽,
唐文武*:肇庆学院生命科学学院,广东 肇庆
3 出处和链接:吴秀兰, 李绮晴, 郑珊丽, 黄万信, 钟华斌, 唐文武.
新冠病毒Omicron变异株S蛋白变异位点及进化分析[J]. 计算生物学, 2022, 12(4): 59-65.
https://doi.org/10.12677/HJCB.2022.124008
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摘要:新冠病毒Omicron变异株是2021年11月首次在南非发现,并已成为当前传染性最高的主流变异株,其传染性和S蛋白位点变异存在相关性。本文通过生物信息学方法对Omicron变异株的S蛋白变异位点进行分析,并与多种冠状病毒S蛋白进行多序列比对及构建系统进化树。结果显示Omicron变异株S蛋白序列保守性较高,共发现26个变异位点,其中K417N、Q493R、N501Y、Y505H变异位点可能增强病毒感染性。序列比对显示该变异株与Zeta变异株一致性最高,达到98.11%,其次与猫、猴的冠状病毒S蛋白序列一致性皆为98.04%,与Lambda变异株相似性最低,其一致性为97.01%。本研究有助于了解Omicron变异株S蛋白的功能,并为后续筛选靶向药物提供理论依据。
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