加载中…quantile normalization 分位数标准化
(2017-10-26 15:36:06)
标签：
生物数据分析 |
为了说明分位数标准化，我们采用一个小型的数据集合来说明
①.比如有下面的一个数据集
说明：横行为一个基因不同样本的数据，纵行是每个基因对应样本的值
A
5
4
3
B
2
1
4
C
3
4
6
D
4
2
8
②.对于每一列，按照它们的数值大小确定它的级别（用罗马数字Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ表示 ）
A
Ⅳ
Ⅲ
Ⅰ
B
Ⅰ
Ⅰ
Ⅱ
C
Ⅱ
Ⅲ
Ⅲ
D
Ⅲ
Ⅱ
Ⅳ
③.先不看排序的值，回头来看①中的数据，将每一列的数据按照从小到大排序（此时是为了后续的计算，所以进行这种操作，没有改变了各个基因的数据）
A
2
1
3
B
3
2
4
C
4
4
6
D
5
4
8
④.然后求取每行的平均值，并标明平均值的级别（用㊀㊁㊂㊃表示）
A
（2+1+3）/3 = 2.00 级别 ㊀
B
（3+2+4）/3 =
3.00 级别 ㊁
C （4+4+6）/3 =
4.67 级别 ㊂
D
（5+4+8）/3 =
5.67 级别 ㊃
⑤.然后将②中的级别按照对应关系将数值替换
对应关系
Ⅰ
------> ㊀(2.00)
Ⅱ ------> ㊁(3.00)
Ⅲ ------> ㊂(4.67)
Ⅳ ------> ㊃(5,67)
A
Ⅳ
Ⅲ
Ⅰ
------>
A
5.67
4.67
2.00
B
Ⅰ
Ⅰ
Ⅱ
------>
B
2.00
2.00
3.00
C
Ⅱ
Ⅲ
Ⅲ
------>
C
3.00
4.67
4.67
D
Ⅲ
Ⅱ
Ⅳ
------>
D
4.67 3.00
5.67
⑥.得到了一个新的数据集
A
5
4
3
<------>
A
5.67
4.67 2.00
B
2
1
4
<------>
B
2.00
2.00
3.00
C
3
4
6
<------>
C
3.00
4.67
4.67
D
4
2
8
<------>
D
4.67 3.00
5.67
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