10-8螺旋构架巧天工
(2025-10-09 15:03:53)
氨基聚裂演无穷,螺旋构架巧天工
科研志士齐努力,中芯推演圆古今中国科学院微生物研究所团队与北京大学化学与分子工程学院团队合作在《自然》上发表相关论文,利用人工智能蛋白语言模型揭示生命演化的奥秘。
该项研究一反化石研究以及DNA序列比对传统,将训练的人工智能蛋白语言模型当作进化时间机器,通过分析现代蛋白质序列,反向推出它们古老的祖先系列,并验证其功能。研究人员构建了一个包含数亿个蛋白序列数据库作为基本文本库,利用上述数据训练一个名为ESM蛋白语言模型,关联性越强、越刚性的部分进化得越慢,代表其历史古老。关联性越弱、越灵活的部分进化得越快,代表其相对年轻。利用定义好的时钟,从现代回溯祖先,并复活古蛋白,验证其功能。他们发现古蛋白具有更广泛的物适性,现代后代蛋白质功能更加特化……模型还预测远古可能存在但是现在已经不存在的“暗蛋白”是进化丢失的分支。验证酶由通用到特化的进化路径,构建更精细生命演化树,为蛋白设计提供新范式………
科研志士齐努力,中芯推演圆古今中国科学院微生物研究所团队与北京大学化学与分子工程学院团队合作在《自然》上发表相关论文,利用人工智能蛋白语言模型揭示生命演化的奥秘。
该项研究一反化石研究以及DNA序列比对传统,将训练的人工智能蛋白语言模型当作进化时间机器,通过分析现代蛋白质序列,反向推出它们古老的祖先系列,并验证其功能。研究人员构建了一个包含数亿个蛋白序列数据库作为基本文本库,利用上述数据训练一个名为ESM蛋白语言模型,关联性越强、越刚性的部分进化得越慢,代表其历史古老。关联性越弱、越灵活的部分进化得越快,代表其相对年轻。利用定义好的时钟,从现代回溯祖先,并复活古蛋白,验证其功能。他们发现古蛋白具有更广泛的物适性,现代后代蛋白质功能更加特化……模型还预测远古可能存在但是现在已经不存在的“暗蛋白”是进化丢失的分支。验证酶由通用到特化的进化路径,构建更精细生命演化树,为蛋白设计提供新范式………
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