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小技巧 – 如何从SIMCA-P+中导出score plot等分析图的数据?

(2013-07-31 14:40:00)
标签:

分析图

相关系数

得分图

simca-p

分类: 技术交流

目前,很多做代谢组学的同仁们都在使用SIMCA-P+软件,并得到score图,loading图等。这些图的样式是按照软件规定的格式来设定的。但有很多研究者想要把这些图对应的数据导出来,然后做成个性化的或创新的图。那么这期的小技巧题目是:如何将这些图的数据从SIMCA-P+中导出来。

  1. 在SIMCA-P+中,把所有的分析完成,包括PCA,PLS-DA等。
  2. 在工具栏里寻找plot/list按钮,点开下拉菜单,并选择Lists菜单。
  3. 出现一个Lists对话框,在此对话框里根据需要而选择相关参数,最后导出数据。

如导出得分图相关数据的截图如下(红线标注处为修改部分):

http://s13/mw690/d18b3b65gx6BudWhc1C0c&690– 如何从SIMCA-P+中导出score plot等分析图的数据?" TITLE="小技巧 – 如何从SIMCA-P+中导出score plot等分析图的数据?" />

 

数据的type选择Variables and Scores,得分图的数据Item选择t,若需要改变主成份可在Pred Comp中选择,需要多几个Series时,可以点击Add series,最后点击OK,所有的数据则会以列表的格式显示出来,然后全选、粘贴、复制就可以导出到EXCEL表中。

再比如相关系数图,根据要求type选择Observations and Loadings,而Item选择p,Num,Pc(corr),最后点击OK,数据即可导出来。导出来的数据放入到MATLAB中进行画图既可。

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