一、自花授粉作物
1、表现型与基因型一致，体现在外观上相对相似。由于长期自交，品种内个体基因型基本纯合，遗传稳定、性状较一致，品种保纯较容易。
2、自交繁殖后代退化不明显。
3、亲代和子代间遗传行为的相对稳定性。
4、偶然会出现异交或基因突变，但频率低、且随繁殖世代增加，纯合体比率增加。
二、 异花授粉作物
1、遗传上杂合程度大，品种群体内个体间基因型、表现型多样性，群体内基本上没有基因型完全相同的个体。
2、自交退化、杂交产生杂种优势  如果连续自交，可以获得异花授粉作物的纯合体。但伴随着遗传物质的同质化，株高、种子产量有衰退表现；但来源不同的自交系间杂交，可获得有优势的杂种。
3、亲代和子代间性状的变异性  群体中选择的优良个体，后代出现性状分离，优良性状不能稳定遗传，需自交和多次单株选择才能获得较稳定的纯合后代和保证选择的效果。
4、基因突变难于识别、难于纯合  异花授粉作物性细胞发生突变时，如果是显性突变，由于表现型呈多样性不易识别；若是隐性突变，异花授粉的结果，隐性性状将较长时间地在群体内保持一质性，早代不能表现，不易被人们发现。只有将突变体进行两次或两次以上的人工自交，才能使他们得以表现，并获得纯合的突变体。  
(三) 常异花授粉作物(常异交作物)  1、遗传基础基本上是纯合的，但有一定的杂合性；2、自交一般不会引起生活力显著退化。
(四) 无性繁殖作物
1、个体间基因型、表现型一致，性状稳定(这是基本特点)  该类品种都是杂合程度很高的基因型，它是通过一个作物有机体的个别器官而繁殖的，没有发生有性过程，也没有发生双亲遗传物质的重组、交换等，所以其后代没有分离现象。但如果进行有性繁殖，杂种一代就会出现复杂的多样性分离。
2、经常发生体细胞突变，因此芽变是无性繁殖作物育种的有效途径。芽变是分生组织体细胞突变的一种表现形式，芽变发生于多年生作物中，它是遗传物质的突变。只要将它从母体上及时分割下来进行繁殖便可获得突变体，它对药用作物育种具有重要意义。
3、无性繁殖与有性繁殖互换是无性繁殖作物的特有形式  有性繁殖后代产生性状分离便于选择优良个体。优良个体无性繁殖可以固定杂种优势，“永久”得到利用，这对培育新品种极为有利。
由上三点可见，无性繁殖作物育种工作比较简便，能较快的培育新品种，良种繁育不存在串粉问题。但无性繁殖作物有病毒感染、退化问题。
三、不同繁殖方式作物的育种特点
(一)自花授粉作物的育种特点  在自花授粉作物育种中，单株选择是一种常用的方法，在性状分离的大群体中进行多代选择，多中选优，优中选异，才能选出综合性状优良的理想类型。
通过对自然群体中变异单株的选择和鉴定，可以选出优良的单株后代，并从中培育出新品种。由于自花授粉作物的自然异交率较低，所以在育种试验及良种繁育过程中，一般不必设置隔离区，但要注意防止机械混杂。自花授粉作物杂种优势利用的潜力很大，主要途径是利用雄性不育性生产杂交种子。
(二)异花授粉作物的育种特点  在育种方法上，主要是利用杂种优势。首先通过多次的自交和单株选择来获得性状稳定的优良自交系，然后利用遗传基础不同的自交系杂交产生杂种优势。在良种繁育过程中，由于异花授粉作物的自然异交率较高，所以要做好安全隔离，严防生物学混杂。
(三)常异花授粉作物的育种特点  常异花授粉作物进行育种工作，在育种方法上基本上与自花授粉作物一样，采用单株选择和杂交育种的方法。但由于常异花授粉作物会发生一定程度的异交率，所以杂交中选用的杂交亲本要进行必要的自交和选择以淘汰劣系，选纯合的优系做杂交亲本，这样育种效果会更好。在杂种优势做用中，主要的途径也是利用雄性不育性来生产杂交种子。在良种繁育过程中，仍有必要做好安全隔离，防止生物学混杂。   
(四)无性繁殖作物的育种特点 (1)营养系品种主要通过有性杂交和无性繁殖相结合的方法育种。在进行有性繁殖时，由于无性繁殖作物本身一般都是杂种，所以一方面可利用种子后代进行选择，另一方面当选得优良材料后，就可以通过无性繁殖把它固定下来，形成新的无性系，以保持优良的特性和杂种优势。通过鉴定，即可大量繁殖推广。(2)芽变育种是营养系品种选育的一个有效方法，芽变选择育种是营养系品种育种的另一个重要特点。在进行无性繁殖时，一般多采用芽变的选择和单株繁殖法来培育新品种。芽变是体细胞突变的一种表现形式，在性状上表现出与原类型不同。当有利的芽变一旦出现，通过选择即可用无性繁殖方法把它们迅速稳定下来，培育成为新品种。(3)淘汰劣变的芽变类型是营养系品种繁育保纯的重要措施。
第二节    选择方法
一、选择的作用及其遗传原理
(一) 选择的实质  育种中的选择是指在群体中选优汰劣。选择使群体中一部分个体产生后代，其余个体因受淘汰而不能产生或较少产生后代，所以选择的实质就是造成有差别的生殖率，或叫差别繁殖。从而起到定向地改变群体的遗传组成的作用(或效果)。
(二)选择的作用： 1、创造作用  选择是育种工作的主要内容。选择有自然选择和人工选择。自然选择是自然环境对生物所起的选择作用，“物竞天择，适者生存”。人工选择朝着人类需要的性状(即经济性状)方向发展。生物体内经常会发生微小的变异，通过选择，能使微小的变异得以保留和积累、加强变异，能够选出超亲的变异类型和性状组成，最终产生大的变异，获得原始群体内不曾有过的变异类型(亚种和种)，从而产生创造作用。例如，美国对波尔白玉米未经过选择的原始群体进行含油量和蛋白质含量的连续70年正向(高)和负向(低)选择，结果后代的高含油量由原群体的4.7%提高到16.6%，低含油量则降为0.7%，分别是原始群体的35.4%和14.9%；高蛋白质含量由原群体的10.9%提高到26.6%，低蛋白质含量降至4.4%，分别是原始群体的244%和40%。所以从这个意义上讲，定向选择具有创新作用。
2、保留和积累变异  育种实践证明，通过连续定向选择，可以显著地改变原始群体的面貌，从而出现新的变异，有利基因的积累和基因累加作用。
(三)选择的遗传原理   达尔文的生物进化学说，是人工选育新品种的理论基础，其中心内容是变异、遗传和选择。变异是选择的基础，为选择提供了材料，没有变异就不会出现对人类有利的性状，也无从选择。遗传是选择的保证，没有遗传，选择也就失去了意义。
有了有利的并能遗传的变异，还要通过不断的选择把它们保留和巩固下来。同时，选择还能促进变异向有利的方向发展，使微小变异逐渐发展成为显著的变异，从而创造出各种各样类型的品种。因此说：变异是选择的基础，遗传是选择的保证，而选择又决定着变异和遗传的发展方向。
变异有自然变异和人工创造的变异。现代作物育种工作既要充分利用自然界已有变异，更要运用人工杂交、人工诱变和生物技术等方法，有计划、有目的的创造变异，为选择提供更符合人类需要的丰富多彩的材料。

   变异有遗传变异和不遗传变异，通过杂交、诱变等方式，使生物体产生基因重组，突变、染色体畸变等，这些变异是能够遗传的。由一般环境条件影响所引起的变异，如由于位置不同而引起的处所变异，由栽培过程中施肥、灌水等条件引起的傍惶变异，只是表现型出现某些变化，而基因型并未改变，都是不遗传的变异。对遗传变异选择是有效的，而对不遗传变异选择是无效的。在作物育种中;选择就是选择遗传的变异，并选择有利的性状。
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