1、序列校正

（1）序列比对

打开软件Mega 6.0，导入参考序列和测得的序列（插入新序列文件可使用“Ctrl+I”），将反向测得的序列进行“Revers Complement”，然后将测得序列分别与参考序列进行“Alignment”。

http://s10/mw690/003wenQtzy6KyUFrlEt59&690

（2）序列输出：输出为fasta格式文件，例如123.fasta。

http://s2/mw690/003wenQtzy6KyUFPdlfd1&690

（3）碱基编辑（Bioedit软件）

打开Bioedit软件，“File”“Open”，打开上述比对后的fasta文件，即本例的123.fasta。模式（Mode）选择“Edit”，“Overwrite”；选择修改模式为“右键插入”，即“I”图标。对序列碱基进行编辑。删除序列使用键盘上的“-”键。编辑完成后，删除参考序列文件。

http://s15/mw690/003wenQtzy6KyUGp7Ns6e&690

（4）文件输出

点击“File”“Save As”，保存为fasta格式，本例保存为123.fasta，覆盖旧文件。

http://s15/mw690/003wenQtzy6KyUGK7O6ee&690

2、序列拼接（DNAMAN软件）

（1）软件打开

打开DNAMAN软件，点击“Sequence”“Sequence Assembly”

 http://s8/mw690/003wenQtzy6KyUXsuZFb7&690

（2）载入序列

在弹出的“Sequence Assembly”窗口中，点击“Add File”按钮，选择比对校对编辑后的文件，即本例中的123.fasta文件。

http://s13/mw690/003wenQtzy6KyUY1XDScc&690

（3）序列拼接

按照图示进行相关设置，然后按“Assembly”按钮，查看拼接情况，按“Show Result”显示拼接结果。

http://s1/mw690/003wenQtzy6KyUYAXpS50&690

（4）输出拼接结果

窗口下方显示序列拼接情况，红线表示有不一致碱基，可以双击查看并修改。

http://s15/mw690/003wenQtzy6KyVeh8sKce&690

（5）保存结果

最后点击“Export”输出拼接后的结果，点击“File”“Save As”保存一致序列。