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流式分选注意事项

(2013-12-11 14:36:41)
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文化

分类: 流式检测和分选
流式分选是做亚群细胞必备的一个技术和平台。相比磁珠分选,流式分选的灵敏度和纯度要高些。
分选倒主要是操作上的问题,分选后的细胞活性、无菌等可能是技术难题!

转载:

                 流式分选注意事项

1.
安全性问题由于在分选过程中,样本可能通过液滴震荡产生气溶胶,所以不接受会传播人类病原菌的生物有害样本,也不接受含放射性生物样品。
2.
应知道细胞的大小与形态,以便选择分选用喷嘴所分选细胞的直径最好小于喷嘴直径的1/5,至少小于1/3。细胞的形态也影响了分选的结果,理论上越接近于球形的细胞,分选过程中的剪切力对细胞造成的伤害就越小。形态特殊的细胞应选择较大的喷嘴,以减轻分选过程对细胞造成的伤害。
各种细胞的建议浓度和所用喷嘴如下表。
Table 1
细胞种类和浓度、喷嘴的选择
细胞种类
浓度
喷嘴
Lymphocytes, thymocytes or splenocytes (直径8-12 μm)
8 - 12 × 106 /ml
70μm
Activated lymphocytes, smaller cell lines (直径12-20 μm)
7- 9 × 106 /ml
70μm
Large adherent cell line (直径>20 μm)
5 - 8 × 106 /ml
100μm
3.
荧光染料的选择:如选择14个荧光标记,一般按如下顺序选择,FITCPEAPCPerCP

三、样本制备

使用者可依其需要使用各种不同的实验流程,如抗体荧光标定 (antibody labeling) 或荧光基因转染 (transfection)但在上机前必须完成下列程序:

1.  样品必需事先使用nylon mesh (Cell Strainer, mesh size: 40 µm, Falcon cat# 352340)过滤,或使用具有过滤功能之无菌管 (Falcon cat# 352235),也可使用300目滤网过滤;同时必须去除红细胞。若因样品原因上机而引起机器堵塞及损坏,需负赔偿之责任。各种细胞的建议浓度如下表。



1.
样本制备基本流程:
获取细胞悬液→荧光抗体染色→调整细胞浓度(参考Table 1)→避光置冰上运至分选室→移入带过滤头的流式管→上机检测并设定分选条件→试分选并上机检测纯度→分选细胞。

2.分选所用的细胞染色方法与分析所用方法基本相同,但需要注意以下几点:
a)保证样本的无菌状态,因为分选得到的细胞还要继续培养
b)不同使用固定剂固定细胞,因为活细胞经固定剂处理后即死亡
c)保证上机样品为单细胞悬液(我们提供带过滤头流式 (Falcon Cat# 352235
d)准备充足的细胞,详见FAQ3
e)分选缓冲液使用含2�S BSAPBS普通培养基中的酚红可能会干扰分选
f)如细胞分选后需再次培养,请准备含血清的收集管,在分选前交操作员建议在15ml离心管中加入1-2ml血清及其它必需组分,保证分选完毕时血清浓度大于5%
g)如要分选GFP转染的样品,请提供未经转染的相同细胞为阴性对照
h)如要做多重荧光染色标本的分选,请提供各种单一荧光染色的标本
i)如要去除死细胞,在不影响后续实验前提下,可以加入7-AAD或是PI
j)快速简便的样本处理有利于分选处理好的样本尽快上机分选好的细胞尽快下一步实验如果要分选多个样本,建议一次处理一个,估计可能的上机时间后,再处理第二个样本


.常见问题

Q1. 上机样品需要溶在何种溶液中?是否可以就直接放在原本培养的培养基中?
Ans建议不要放培养基中,因为Phenol Red可能会影响分选的结果,可先尝试使用含2�SBSAPBS作为分选缓冲液。如要求更好的细胞存活率,按分选细胞不同,选择不同的分选缓冲液。
1.淋巴细胞(HBSS配方中的阳离子可增进细胞的生存力。如果这些细胞并非易于群集细胞,可以选用没有EDTA缓冲液)。
a)1 mM EDTA, 25mM Hepes (pH7.0) and 0.5% - 2% BSA in 1× PBS (without Ca2+ and Mg2+)
b)1× HBSS (without phenol red) with 1% BSA
c)0.5% - 2% BSA in PBS(without Ca2+ and Mg2+)

2.贴壁细胞(以Trypsin处理后去准备单细胞悬浮液时,待细胞变圆(切记不可过度作用),以适量含5%血清培养液收取细胞,并均匀地打散细胞悬浮液。离心后,用分选缓冲液调整细胞浓度。如果需要的话可以提高EDTA的浓度(5mM)以避免细胞重新黏聚)。
a)5 mM EDTA, 25mM Hepes (pH7.0) and 0.5% - 2% BSA in 1× PBS (without Ca2+ and Mg2+)
b)0.5-2% BSA in PBS(without Ca2+ and Mg2+)

3.含有高比例死细胞的样本(这些配方可减少因死细胞释放出来的DNA所造成的细胞黏聚现象。)
5mM MgCl2, 1 mM EDTA, 25mM Hepes (pH7.0), 25-50 μg/mL DNAase I and 0.5% - 2% BSA in 1× PBS (without Ca2+ and Mg2+)

4.建议询问有经验者(使用相同细胞进行过分选)的分选缓冲液配方
Q2. 如果细胞要再培养,会污染吗?
Ans分选所用的所有溶液都经高温高压灭菌,流式分选仪管路使用70%乙醇定期清洗,仪器所房间在每次分选前紫外灭菌,最后在细胞培养基中加入抗生素可将污染机率降至很低

Q3. 如果我想在分选后拿到1×106的细胞我应该一开始准备多少细胞去做分选?
Ans假设你要的细胞只占总数的10%,则你所需准备的细胞数如下公式: 1×106=10%× 50%回收率× 20×106(起始细胞数),所以你需要准备2×107细胞。高速分选、纯度模式(purity vs. yield mode)、部分细胞黏附于上样管壁、部分
细胞用于样本分析、长时间分选过程中细胞的死亡等等,对会降低回收率。50%回收率是一个一般的参考值。

Q4. 通常做一次细胞分选需要多久时间?
Ans分选的过程有三个步骤,分别为设定分选区域、分选及分选后的分析。设定分选区域约需15-20分钟。分选的时间决定于细胞数目,虽然机器的分选速度最高可达70,000细胞/sec,但为得到最佳分选结果,我们通常设定分选速度为10,000-20,000细胞/。因此,如欲分选2×107细胞,其所需分选时间约为17-34分钟。分选后约需15-20分钟去分析及打印结果。所以,总共约需1-1.2小时去分选2×107细胞。

Q5. 一个样品可以同时分选出几种细胞?
Ans: FACSAria可以从一个样品中最多同时分选出四种不同的细胞。

Q6. 可以同时使用多少参数进行细胞分选?
Ans: FACSAria最多可以根据15个参数去定义及分选一群细胞 (检测488 nm 激光对应的5种荧光信号及SSCFSC,监测633 nm 激光对应的2种荧光信号,检测375nm 激光对应的2种荧光信号,另有四个可扩充的空白通道)

Q7. 分选后细胞的纯度有多少?
Ans通常可以达到95%以上的纯度,如果所分选细胞可以和其他细胞群较好的区分。

Q8. 如果阳性的细胞占总数的1%以下,还可以做分选吗?
Ans可以,但是低含量细胞的分选会导致低纯度及低回收率。因此,我们建议使用者事先富集你感兴趣的细胞。细胞富集的方式可以是正选:如用磁珠法富集你感兴趣的细胞;也可以是负选,如利用nylon wool去除B细胞,或磁珠法去除不要的细胞。

Q9. 分选时所使用的管子有哪些?
Ans上样一般使用我们提供的带滤网5ml流式管;收集可以使用下面这三种15ml离心管(最多双路分选)5ml带盖流式(Falcon tube #352003) (最多四路分选),或1ml Microtube(最多四路分选)

Q10. 可不可以把分选后的结果文件带走?
Ans可以提供FCS 2.03.0格式的流式分析结果,邮件发送或提供下载,进一步分析可使用免费软件WinMDI或商业软件FlowjoFCSExpress软件。


2.  若细胞分选后需再次培养(无菌分选),请准备含合适培养液之收集管,于分选前交操作员。建议在15ml离心管中加入8 mlmedium或在5 ml离心管中加入2 mlmedium当细胞分选时的垫底液(cushion)

3.  若欲分选GFPYFPDsRed单色基因转染之样品,需提供未经转染的相同细胞为控制组标本,以作为分选前仪器校正之用。

4.  若欲以多重荧光染色执行分选,需提供各种单一荧光染色之标本作为分选前调整校正之用。

5.  本服务项目以无菌分选为主,委托服务者需提供无菌状态之样品。 

 

三、申请流程与注意事项:

流式细胞分选服务流程

步骤一:预约申请

1. 预约时间:开放预约时间期限为前1.

2. 时间: AM 10:00-11:30PM 1:30-4:00

3.请预约者务必准时上机,未能在预约时段开始30分钟内将样品准备好并完成上机者则视同弃权并记一次违约 (譬如预约时段为10:00-11:30,请于10:30前准备好样品并上机)

4. 取消预约:最迟请于预约时段前一天取消预约,否则记一次违约。

5. 同一使用者若违约累计三次,则禁止此使用者使用此服务一个月。

步骤二:先以分析型流式细胞仪确认样本

1.本仪器仅限于为无菌细胞分选。

2. 分析样品者请使用FACSCalibur或其它流式细胞仪

步骤三:上机日也请携带一片光盘片(CD-ROM)以便带回分选后的电子文件。

.常见问题及答复

Q1. 上样样品需要溶在何种溶液中呢?是否可以就直接放在原本培养的medium呢?

Ans: 建议不要放medium中,因为Phenol  Red会影响分选的结果,一般建议放置于Sorting Buffer,配方如下:

Sorting Buffer:

•   1 × Phosphate Buffer Saline or HBSS (Ca/Mg++ free)

•   1 mM EDTA

•   25 mM HEPES pH 7.0

•   1 % Fetal Bovine Serum (Heat-inactivated)

•   0.2 mm sterile filtered, store at 4℃

依分选之细胞不同,Sorting buffer可稍做调整,其方式如下列所示:

淋巴细胞:

1x HBSS(with Ca++/Mg++)1% FBS

HBSS配方中的阳离子可增进细胞的生存力。由于这些细胞并非易于群集细胞,即便配方中没有EDTA也不会造成问题。

 

较黏着的细胞(sticky cells)

提高EDTA5mM 并使用透析过的FBS (against Ca++/Mg++ free PBS)。某些细胞在活化会比较黏着而EDTA可抑制此作用。

 

贴壁型细胞株(Adherent cells)

Trypsin处理后去准备单细胞悬浮液时,待细胞变圆(切记不可过度作用),便以5 ml5%血清培养液收取细胞,并均匀地打散细胞悬浮液。离心后,用sorting buffer调整细胞浓度。如果需要的话可以提高EDTA的浓度(5mM)以避免细胞重新黏聚。

 

含有高比例死细胞的样本:

Sorting buffer5mM MgCl2以及25~50 μg/mL DNAase I (Sigma D-4513)或是Sorting buffer0.83mM MgCl2以及20 U DNAase II (Sigma D-4138)。这些配方可减少因死细胞释放出来的DNA所造成的细胞黏聚现象。

(资料来源http://facs.scripps.edu/SortLink/buffer.htm)

Q2. 如果细胞要再培养,会污染吗?

Ans: 目前机器会在分选前会固定做清洗,但是因为仪器所处环境仍非无菌,故建议带来要接收分选细胞的medium要加入抗生素,以减低污染之机率。

Q3. 如果我想在分选后拿到1x106的细胞我应该一开始准备多少细胞去做分选?

Ans: 假设你要的细胞只占总数的10%,则你所需准备的细胞数如下公式: 1x106=10%x 50%回收率x 20x106 (起始细胞数),所以你需要准备2x107细胞。分选速度、方式(purity vs. yield mode)及细胞在分选前状况的好坏都会影响回收率。50%回收率是把所有因素都列入考虑的最低参考值。

Q4. 通常做一次细胞分选需要多久时间?

Ans: 分选的过程有三个步骤,分别为设定分选区域、分选及分选后的分析。设定分选区域约需15-20分钟。分选的时间决定于细胞数目,虽然机器的分选速度最高可达70,000细胞/sec,但为得到最佳分选结果,我们通常设定分选速度为10,000-20,000细胞/sec。因此,如欲分选2x107细胞,其所需分选时间约为17-34分钟。分选后约需15-20分钟去分析及打印结果。所以,总共约需1-1.2小时去分选2x107细胞。

Q5. 一个样品可以同时分选出几种细胞?

Ans: FACSAria可以从一个样品中最多同时分选出四种不同的细胞。因此positivenegative的细胞也可以同时分选出来。

Q6. 可以同时使用多少参数进行细胞分选?

Ans: FACSAria最多可以根据11个参数去定义及分选一群细胞 (488 nm laser可侦测5种荧光讯号及SSCFSC633 nm laser可侦测2种荧光讯号,375nm可侦测2种荧光讯号)

Q7. 分选后细胞的纯度有多少?

Ans: 通常我们会预期95%以上的纯度如果positive的细胞占总数的5%以上。

 

Q8. 如果positive的细胞占总数的1%以下,还可以做分选吗?

Ans: 可以,但是低含量细胞的分选会导致低纯度及低回收率。因此,我们建议使用者事先enrich你有兴趣的细胞。细胞enrichment的方式可以利用nylon wool去除B细胞,panning或是用magnetic beads (from StemCell or Miltenyi)去除不要的细胞。

Q9. 分选时所使用的tube有哪些?

Ans: 可使用15ml离心管(单或双向分选)5ml无菌管(Falcon tube #352003) with snap cap (三或四向分选)

Q10. 可不可以把分选后的电子文件带走?

Ans: 可以,由于此细胞分选仪使用FACSDiva软件(PC界面)做分析,我们必须把结果用FCS格式输出,使用者拿回数据后可以利用FCS converterFCS转换后用CellQuest软件(Apple界面)或其它软件做分析。

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