明万历三十一年（1603），努尔哈赤始建城堡于此。两年后，又增修外城。内城周2千米，努尔哈赤及其亲族居住。外城周4.5千米，居住精悍部卒。外城北门外，铁匠、弓匠分区居住。四十四年，努尔哈赤即汗位，建国号为金（史称后金），建元天命，定都于此。天命六年（1621），始迁都至辽阳。天聪八年（1634），尊为兴京。今仅内、外城城墙有部分残存，城门遗迹尚清晰可辨，其余建筑已荡然无存。

2006年05月25日，赫图阿拉故城作为明代古遗址，被国务院批准列入第六批全国重点文物保护单位名单——摘编自网络。