农产品质量安全要求从要求最终产品合格转向要求种植养殖环节规范、安全、可靠，积极推崇和推行农产品质量安全从“农场到餐桌”全过程控制，随之产生了生产管理和控制体系及相应的体系认证。以下是五大农产品认证体系：
　　1.HACCP体系认证。HACCP是Hazardanalysiscriti和calcontrolpoint的英文缩写。美国食品药品监督管理局于1973年将HACCP原理引入低酸罐头食品加工的GMP规范之中，美国食品微生物标准顾问委员会在1992年正式明确了食品生产HACCP体系的7个基本要素：进行危害分析、确定关键控制点、设立临界值、确立监控程序、建立纠偏措施、制定核查程序、实施过程记录和保存归档。随后美国政府相继在水产品、禽肉业、果蔬汁加工业实施HACCP规范。目前，美国食品零售业和乳品业HACCP规范正在进行制定和试点。与此同时，HACCP体系在欧盟、加拿大、澳大利亚和国际食品法典委员会（CAC）也得到了广泛的认可和推行。1997年新版《HACCP体系及其应用准则》被许多成员国所接受和采纳。
　　2.GAP体系认证。GAP是英文GoodAgriculturalPractice的缩写，其核心和实质是农产品规范化管理、标准化生产，以Eu鄄repGAP为典型代表。EurepGAP由欧洲零售商联合会所创立，其体系包括标准体系和认证体系两个部分。EurepGAP对农产品产地、生产控制、质量安全、环境保护等方面都有明确的规定和要求。在欧盟内部，除德国及法国外，所有成员国都在全面采纳和推行EurepGAP体系。
　　3.GMP体系认证。GMP是英文GoodManufactoringPractices的缩写。食品GMP于20世纪60年代诞生于美国。目前，美国已立法强制实施食品GMP,日本、加拿大、新加坡、德国、澳大利亚等国政府也在积极推动。食品GMP详细规定了食品加工、贮藏、流通等各个工序中所要求的操作和管理以及控制规范，对人员卫生健康、建筑设施、加工工艺等软硬件都作出了详细的要求和规定。
　　4.On-Farm体系，即田间食品安全体系（On-FarmFoodSafetySystem）.该体系是为减少农产食品生产和加工过程中不安全因子产生的风险，确保农产食品加工和消费都能获得高质量的产品而采取的安全管理措施。该体系源于加拿大，目前已受到广大农产品生产者和消费者的关注与推崇。
　　5.SQF体系，即食品质量安全（SafeQualityFood）体系。该体系专门用于食品加工行业的全程质量安全管理，1995年开始于澳大利亚，2003年该体系监管权移交给了位于美国华盛顿的美国食品营销组织（FMI）.目前，SQF体系已被有关方面推荐为最符合从“农田到餐桌”全过程监控的体系之一。