由学生办学校，是博洛尼亚大学的起源。然而，对现代大学更重要的贡献却来自一位好战的君主。

1158年，雄霸欧洲的神圣罗马帝国皇帝,腓特烈一世入侵意大利，北部城邦全部陷落，博洛尼亚也在其中。这位在历史上六次入侵意大利，一向暴戾的“红胡子”皇帝，却对知识的价值非常尊重，在听取了博洛尼亚大学四位学生的建议后，他对那些为了追求知识而被迫远离家乡的人表示钦佩，并愿意为他们提供保护。

为此，他颁布了一项学术特权法令。

【采访】吴军 学者 《浪潮之巅》作者：

你可以做一些自由的学术研究，不要因为你的观点怎么样，然后你就受到当地的行政长官的迫害，如果和当地发生了冲突了，这些人可以不由当地行政长官来裁判，由教会来裁判。另外大学的教授享受僧侣文的一些特权，因为在欧洲当时僧侣是第一阶层，贵族才是第二阶层，一般商人、平民是第三阶层。

这份特权使大学的学生和学者拥有了崇高和自由的地位，大学不受任何权力影响，作为独立研究场所享有自治的权利。“学术特权”在冥冥之中成就了大学独立治学的渊源。

随后三百多年里，博洛尼亚大学的声誉传遍欧洲。这里成为最著名的罗马法学术圣地，还增设了神学、医学、哲学、天文、算术等等学科。