当抗生素大量地进入到自然环境中以后，就会促使整个大自然形成各种抗药细菌。细菌适应抗生素的进化过程，在抗生素诞生之后就慢慢开始了，而且每出现一种新的抗生素，不久就会有某些细菌能够抵抗它的药性。更可怕的是，很多细菌已经从原来的单药耐药性，变成了能够抵抗多种抗生素的超级细菌。

2013年，美国的《国家科学院院刊》上刊登了有八名中美科学家关于抗生素使用情况的研究成果，他们在中国三家饲养场的动物粪便里发现149种抗药性很强的细菌，其中有些是能抗多种抗生素的超级细菌。这些细菌会通过动物体和肉制品传到人的身上，这也就是为什么一些并没有过度使用抗生素的人，却会感染上抗药性细菌的原因，因为在各个人口密度高的环境中，这种抗药细菌已经普遍存在了。

美国每年都有两万多人死于无药可治的细菌感染，而且这个人数每年还在增加。一些悲观的医学家担心，21世纪人类将再次面临没有抗生素可以使用电“后抗生素时代”。直到这时，世界上一些发展状况良好的国开始认真考虑合理使用抗生素的问题了。比如欧盟已经禁止使用抗生素促进农产品生长，澳大利亚和美国干脆禁止了一些种类的抗生素农用。2015年3月，麦当劳宣布两年后在美国，停止采购使用了对人类有影响的抗生素的鸡肉，但是这仅限于美国。人类虽然在较早就认识到抗生素可能产生抗药性问题，但是采取行动已经是半个多世纪后的事情了，这中间的教训值得每一个人，特别是科研人员反思。

抗生素的副作用远不止是让细菌产生抗药性，也在于它的毒性和其它副作用上，而人类对这些副作用的全面认识，同样也是经历了一个非常漫长的过程。最初的时候，人们了解的副作用仅限于因为药品的不纯而导致的过敏，这种过敏非常危险是致命的。因此，在一些国家使用青霉素之前是需要进行皮试的。在使用不同批号的青霉素时，由于里面可能含有不同的杂质，因此都需要重新作。但是皮试本身也有一定的危险性，约有四分之一因为青霉素过敏性休克而死亡的病人死于皮试。因此，皮试时其实也应该作好充分的抢救准备，不过很多医院并没有。在青霉素诞生之后，因为用药不慎而发生的过敏死亡事件时有发生。另外，由于皮试用药量很小，经常进行皮试会帮助细菌产生抗药性，这也是青霉素的副作用之一。

青霉素一旦开始大规模使用，人们渐渐发现它的副作用比想象的多得多，比如青霉素常常以钾盐或者钠盐的形式保存。钾盐常常用于点滴，但是血液中过量的钾离子会抑制心脏功能，造成死亡，因此每次使用前要仔细计算钾离子量。

各种抗生素虽然不会直接伤害到人体细胞，但是并非没有毒性，因为它在人体内要被分解掉的同时，会增加肾等内脏的负担。此外它还有很多不常见但不可忽视副作用。下表列举了各种抗生素主要的副作用：

青霉素        过敏

头孢菌素    过敏

克林霉素    腹痛，假性腹膜炎

阿莫西林    损害肾，神经中毒

甲硝唑    肠胃痉挛

万古霉素    神经中毒，血栓性静脉炎

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可见，人类认识一种东西的好处常常很快，但是认识它们的问题却需要很长的时间。很多事情做起来不能不慎重。