细胞代谢组学样本收集参考步骤
(2017-12-11 14:00:58)
标签:
代谢组组细胞代谢组学代谢组服务 |
分类: 综合项目服务 |
适用细胞类型:哺乳动物细胞(CHO、NS0、CD-hybridoma 细胞系)
一、样品量要求:
1*10 7 cell/sample,提供 2 份样本。
二、样本收集步骤:
1) 使用细胞计数器测定细胞数量,计算出所需淬灭缓冲液的量。下图以细胞数量
1*10 7 为例;
NOTE:
①使用50ml圆锥形管一次处理样本最大量为8ml,如果样本量>8ml,就分开做;②淬灭过程时间敏感,最好两个人操作。
2) 将 5 倍样本体积的淬灭缓冲液加入 50ml 圆锥形管中;
3) 在低温恒温器上预冷淬灭缓冲液至-40℃
(淬灭缓冲液:60%(v/v)甲醇+0.85%(wt/v)碳酸氢铵(pH7.4,使用 12M 的盐酸进行 pH
调节)。如果没有低温恒温器,可以使用干冰代替,并用低温温度计检测温度,保证每管都处于-40℃,温度不能过低);
NOTE: 由于单人操作,最多 2 样本/次,双人操作,4 样/次。保证淬灭处理迅速。因为时间要求“迅速”。
4) 吸取 1 体积的细胞样本(1*10 7 ),加入到盛有淬灭缓冲液的管中央。
NOTE: 温度必须维持在-40℃左右,低于 45℃时,会导致细胞破碎。
5) 缓慢摇晃管子,混匀。
NOTE: 禁止 Vortex 涡旋震荡混匀!
6) 1000g 离心 1min;
7) 去除上清。NOTE:当上清被去除干净后,继续贴壁吸取 5s
以保证上清完全被去除,因为有些上清粘在壁上,回落的话,会对后继操作带来负面影响。
8) 使用 200μl -80℃的甲醇将细胞重悬,并转移到 1.5ml 的离心管中,然后用
液氮冰冻;
9) -80 度冻存。足量干冰寄送。
三、注意事项:
1)淬灭缓冲液 pH 值要在每次适用前重新测定调整。
2)温度要控制好,强烈建议使用-40℃冰柜操作。
四、参考文献:
Sellick C A, Hansen R, Stephens G M, et al. Metabolite
extraction from
suspension-cultured mammalian cells for global metabolite
profiling.[J].
Nature Protocol, 2011, 6(8):1241-9.
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