双萤光素酶报告基因的应用,常见载体及案例简介
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双萤光素酶报告基因检测分析 |
分类: 检测分析服务 |
一、应用方向
1.
验证microRNA同mRNA靶向互作。将待测mRNA的3’UTR序列插入报告基因载体,再共转入该microRNA,如果萤光素酶活性下降,则提示为其靶序列。
2.
验证microRNA同lncRNA靶向互作。将候选的lncRNA序列插入报告基因载体中F-Luc的3’UTR区域,检测萤光素活性。
3.
启动子结构分析。将启动子区域序列(通常2k左右)进行分段截短,或对特定位点进行突变,再分别构建入luciferase报告载体,检测其启动子活性。
4.
启动子SNP分析。一些基因的启动子区域存在单核苷酸多态性,可运用萤光素酶报告系统分析其相对活性。
5.
验证特定转录因子同其调控序列的作用。将该序列(通常为启动子区域)插入报告基因载体,同时在实验细胞中共转过表达该转录因子,可分析转录因子过表达是否提高萤光素酶活性。
6.
可以分析信号通路是否激活。将该信号通路的下游响应原件序列构建入报告基因载体,在不同上游信号条件下,萤光素酶活性代表了通路的下游响应。例如,在GPCR研究中,将cAMP
response
element(CRE)载入报告基因载体,构建稳定表达细胞株后,可以用于分析GPCR的激活与抑制剂筛选。又如,将HIF1α的响应原件hypoxia-responsive
element (HRE)插入luciferase报告载体构建稳转细胞株,可以用于低氧相关通路的研究。
二、常用萤光素酶报告基因载体
pGL3-Basic
pRL-TK
三、经典案例
案例一
题目:Long non-coding RNA linc00673
regulatednon-small cell lung cancer proliferation,migration,
invasion and epithelialmesenchymal transition by
spongingmiR-150-5p
期刊:Molecular Cancer
小结:验证linc00673具有miR-150-5p的靶向结合位点。将linc00673包括预测结合位点的序列克隆到pmirGLO-
linc00673-WT,同时构建靶位点突变的pmirGLO- linc00673-MUT,分别共转miR-150-5p
mimics及NC mimics,结果显示miR-150-5p转染组的相对荧光值降低,提示存在靶向结合。
图:RNA与质粒共转染293T,24h后双萤光素酶检测
案例二
期刊:Oncotarget
小结:验证对于CEACAM1的转录调控作用。分别使用了两种黑色素瘤细胞526mel和624mel,对CEACAM1的启动子区域分别选择了600bp-200bp的截短片段,共转染过表达SOX9,显示SOX9能够抑制CEACAM1启动子的转录。
图:截短的pCEACAM1进行双萤光素酶检测
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