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靶向蛋白质组MRMHR/PRM定量简单介绍

(2017-07-03 14:39:56)
标签:

prm定量

靶向蛋白质组mrmhr

分类: 蛋白质组学分析

基因的产物——蛋白质,反应了生命活动正在发生的事情。蛋白质组成及含量变化的研究愈演愈烈。在蛋白质组学研究中,一方面,WBELISA这些依赖于抗体的检测方法,对抗体质量要求极高。另一方面,基因水平的表达与蛋白含量的变化相关性较差。这些传统的方法都给蛋白含量的分析带来了困难。这个大时代背景之下,MRMHR /PRM堪称“质谱界的WB、定量金标准 U盘中的‘数字化抗体’”便应运而生。

靶向蛋白质组MRMHR/PRM定量简单介绍

靶向蛋白质组MRMHR/PRM定量简单介绍

MRMHR/PRM简介

PRM(平行反应监测, Parallel Reaction Monitoring),靶向蛋白质组,是一种基于高分辨、高精度质谱的靶向定量技术,能够对目标蛋白质/肽段(以及含有修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段的精准定量。借用听来的一个比喻来说,靶向蛋白质组扫描就像精准狙击,排除干扰,目标明确,每一枪直指目标。

其基本原理是:四级杆(Q)首先选出的目标肽段离子,进入碰撞室中打碎后,所有的碎片离子经过质量分析器产生一张高分辨的二级质谱图,通过提取其中的碎片离子信息即可实现目标肽段的定量。

 

 

MRMHR/PRM  VS  WB

靶向蛋白质组MRMHR/PRM定量简单介绍

技术特点

1)灵敏度、重现性和准确度高,定量范围可达到5个数量级,定量重现性CV<10%, 相对误差<15%

2)与经典的WesternblotELISA 技术相比,不需要使用抗体,获得更为准确和重现的定量验证结果。

3)在一个小时检测时间内可同时实现50个蛋白质的定量检测。

4MRMHR/PRM可直接检测二级所有离子,减少了子离子的挑选和优化过程。

应用范围

目标蛋白质/肽段相对或绝对定量,蛋白质翻译后修饰的定性定量研究。

1)定量蛋白质组学(iTRAQlabel-freeSILAC)后,目标蛋白需验证

2)要做WB,却苦于没有抗体

3)有多个蛋白质需同时定量

4)功能研究中涉及到蛋白质定量

 

在应用时,一方面,使蛋白质验证不再受制于商业化抗体,可以应用于多种非模式生物。另一方面,使抗体验证能够高通量的在大规模生物样本上进行,提高实验效率。

靶向蛋白质组MRMHR/PRM定量简单介绍

技术特点

1)灵敏度、重现性和准确度高,定量范围可达到5个数量级,定量重现性CV<10%, 相对误差<15%

2)与经典的WesternblotELISA 技术相比,不需要使用抗体,获得更为准确和重现的定量验证结果。

3)在一个小时检测时间内可同时实现50个蛋白质的定量检测。

4MRMHR/PRM可直接检测二级所有离子,减少了子离子的挑选和优化过程。

应用范围

目标蛋白质/肽段相对或绝对定量,蛋白质翻译后修饰的定性定量研究。

1)定量蛋白质组学(iTRAQlabel-freeSILAC)后,目标蛋白需验证

2)要做WB,却苦于没有抗体

3)有多个蛋白质需同时定量

4)功能研究中涉及到蛋白质定量

 

在应用时,一方面,使蛋白质验证不再受制于商业化抗体,可以应用于多种非模式生物。另一方面,使抗体验证能够高通量的在大规模生物样本上进行,提高实验效率。

Reference:

Phosphoproteins in extracellular vesicles as candidate markers for breast cancer. Proc Natl Acad Sci

 U S A 2017, 114(12): 3175-3180


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