加载中…利用cygwin在windows下安装GROMACS的流程
(2018-05-01 04:00:22)
标签：
文化教育分子模拟 |
分类： 科研 |
1）cygwin的安装
首先在cygwin的网站上下载最新的cygwin.exe文件，https://cygwin.com/index.html
点击下载的cygwin.exe，按照流程安装cygwin软件，在package安装的时候选择all
default的安装。同时也需要安装下面的packages：
Devel – cmake
Devel – flex
Devel – gcc-fortran
Devel – gcc-g++
Devel – make
Devel – pkg-config
Graphics – ImageMagick
Libs – libboost-devel
Libs – libfftw3-devel
Libs – libmpfr4
Shells – tcsh
Utils – patchutils
Interpreters – python
Math – grace
Devel – flex
Devel – gcc-fortran
Devel – gcc-g++
Devel – make
Devel – pkg-config
Graphics – ImageMagick
Libs – libboost-devel
Libs – libfftw3-devel
Libs – libmpfr4
Shells – tcsh
Utils – patchutils
Interpreters – python
Math – grace
2）安装cmake
去cmake的网站上下载最新的linux系统的cmake文件，https://cmake.org/
将下载的文件拷贝到安装的cygwin的home文件夹中，例如C:\cygwin64\home\你的电脑用户名\
打开桌面上cygwin链接，出现cygwin的命令提示符窗口
输入以下命令打开存放cmake文件的文件夹
cd home
cd
你的电脑用户名
之后输入以下命令：
$ tar xvfz
cmake.tar.gz
$ ./configure
$ make
$ make install
$ ./configure
$ make
$ make install
3）安装GROMACS
去GROMACS的网站上下载最新的GROMACS源文件http://manual.gromacs.org/documentation/current/index.html
将下载的文件拷贝到安装的cygwin的home文件夹中，例如C:\cygwin64\home\你的电脑用户名\
打开桌面上cygwin链接，出现cygwin的命令提示符窗口
输入以下命令打开存放GROMACS文件的文件夹
cd home
cd
你的电脑用户名
之后输入以下命令：
$ tar xvfz
gromacs.tar.gz
$ cd gromacs
$ mkdir build
$ cd build
$ cd gromacs
$ mkdir build
$ cd build
$
$ make
$ make install
$ make install
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