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1、北京航空航天大学南通研究生基地

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北京航空航天大学软件学院是第一所落户通州湾科创城的“985”、“211”高校。2013年9月，首批200名全日制研究生入驻通州湾，包括移动云计算、大数据技术与应用、交互设计、互联网营销四大专业。目前，科教城北航学生达400人。通过大规模、高水平的专业人才培养，将为南通软件与服务外包产业的未来发展奠定良好基础。

2、兰州大学南通基地

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2014年11月，首批兰州大学300名学生入驻通州湾科创城。兰州大学南通基地占地约500亩，建筑面积约20万平方米，建成后将入驻不少于500名本科生、500名研究生。通过联合申报各类科技奖励与科研成果，培育引入创新企业，设立国家重点实验室分室。同时与国外知名高校合作办学，推动南通地方经济转型升级。

3、天津大学南通前沿技术研究院

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天津大学南通前沿技术研究院立足在科创城发展新材料、精密仪器与先进制造、海洋工程与新能源学科领域的国家级及省级重点实验室、工程实验室、工程中心，2016年将有100名以上科技人员常驻科创城。未来，天津大学南通前沿技术研究院将结合南通产业发展需求，依托天津大学优势学科及国家级和省部级实验创新平台，重点突破化工材料、先进制造、精密测试、海洋工程、新能源、绿色建筑、环保等领域前沿共性和关键技术，专注于科研产业化应用服务，常驻科创城博士研究生200人左右，积极参与南通市产业和工程的技术难题攻关和技术服务项目。

4、南京航空航天大学南通基地

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南航与市政府在科创城内联合成立南航通州湾研究生院、南航学生实习实训基地、南航南通技术转移中心。研究生院计划每年招生300人，围绕机械、电子、管理三个大类，推动南通及通州湾高端装备制造、航空航天产业、电子信息通信等领域发展。

5、武汉大学技术转移中心江苏分中心

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武汉大学技术转移中心江苏分中心项目占地约100亩，围绕高新技术产品小试、中试与市场化、产业技术服务、产业公共科技服务等主题，优选武汉大学的优势科技资源和科技成果进入技术转移中心，覆盖江苏全境。按照“成熟一个建设一个”的原则，在装备制造、光伏光电、现代纺织、软件科技、生物医药、新能源、新材料、精细化工等领域展开合作，前期主要以智慧建筑项目、城市规划项目、无人机和小飞机研究、合作培养高层次人才等项目为重点，后期立足通州湾科创城，全面推动武汉大学在南通市乃至江苏省的技术转移和科技成果转化工作，为江苏沿海经济与社会发展提供强大技术支撑。

6、西安交通大学长三角科技产业园（南通）

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西安交通大学长三角科技产业园项目占地约180亩，总建筑面积约15万平方米，项目分三期进行。建设科技企业研发办公楼、标准厂房及产业园配套服务设施，计划入驻企业300家，工作人员超过3000人。

7、河海大学南通基地

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河海大学将在通州湾科创城设立研究生院分院，同步建设河海大学南通协同创新园区，占地约1000亩。研究生分院将以南通乃至江苏沿海开发建设紧缺人才实际需求为导向，以新材料、高端制造装备、节能环保等产业为重点，结合河海大学水利工程、海洋工程、土木工程、港口建设、工商管理、社会学等优势特色专业，为南通沿海开发提供强有力人才支撑。

当然，除了上面这些，北京物资学院、上海海事大学、上海电力学院等众多高校也相继落户通州湾。