贝聿铭世界著名的建筑设计师，在1948年他一举成名，1990年正式退休，但是退休之后的他并没有终止自己的建筑设计道路，2005年他亲自设计的科学馆建筑设计图被澳门科学馆的有关负责人采用，他的独特的设计理念再一次成功的展现出来。

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澳门科学馆的整体设计贝聿铭采用了立体透视的构图方式，使澳门科学馆的整体建筑形式呈现出倾斜的圆锥体，同时建筑师贝聿铭也巧妙地以一笔线条勾划出结构的内外两面，充分体现澳门科学馆向公众展示各种科学现象背后的本质和规律的重大使命。贝聿铭利用那简洁的线条配配，让参观者从外表看来澳门科学馆就像一个正被打开和不断将知识向公众传播的书卷以外，也给参观者的视觉感官带来错觉，参观者看着科学馆的外形时而由上而下、时而由下而上的两奇图形，让参观者不断改变自己的视角。此科学馆的外体的全面设计更兼具向左、右两边展开旋转的双重视觉效果，代表着澳门科学馆以多角度向世界各地的参观者展现科学技术的发展与应用。并且沿岸建有海滨步行径，可供游人欣赏澳门两岸景色，教育与旅游元素结合的科学馆，料将成为澳门的又一新景点。

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澳门科学馆馆内的主体结构包括展览中心、天文馆及会议中心三部分组成。馆内的装修设计也是极为重要的，贝聿铭根据馆内的构架，设计了馆内不同展厅的布局。科学馆的主体大楼楼高六层，二楼至五楼总共有14个展览厅（包括科技文明区、基础科学区、环境科学区、生命科学区、材料与新产品区、能源区、自动控制区、资讯科技区、仿真与虚拟现实区等）外，馆内还设有咖啡室、精品店及普通商店，方便参观者休息和购买自己所需要的物品及纪念物；而馆内一楼是贝聿铭设计的天文馆的展区，天文馆是一个直径十五米的倾斜半球形银幕，观众佩戴特殊眼镜后可领略自由穿梭宇宙星辰的立体影像；科学馆会议中心大楼楼高三层，在地面设有一个多功能会议厅，一楼是为即时传译会议室，而二楼则为澳门科学馆的办公室。

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