福建霞浦火车站位于距霞浦县城区东北方向，站址在离城区4公里左右的赤岸村内。站房建筑呈仿唐风格，设计时参考了赤岸村当地的空海大师纪念堂（位于中国福建省霞浦县赤岸村，是为了纪念日本僧人空海大师，由中日双方共同出资修建的一座具有日式风格的纪念堂，于1994年5月21日建成。）。霞浦站是杭深线温福段的主要站点之一。杭深铁路是国家重点建设项目，为国家中长期铁路网规划“四纵四横”客运快速通道之一，属国家Ⅰ级双线电气化铁路。

霞浦站位于温福铁路上，是杭深线福建段先期通车的站点之一。温福铁路北起浙江省温州市的温州南站，经福建省宁德市终到至福州市的福州站，线路全长约298公里。该工程从2004年12月动工，经过4年多的建设，于2009年6月30日率先开通货运，同年9月28日正式开通客运。

杭深线温福段在霞浦境内全长41.858公里，途经牙城、三沙、松港、盐田4个乡镇，先后跨越赤溪、罗汉溪、杯溪三条溪流，穿过大湾山、青岙、霞浦、黄土岭、官岭尾五条隧道，总投资约25.29亿元。尤其霞浦隧道是全国铁路客运专线目前贯通第二长的隧道、也是东南沿海铁路最长的隧道。

候车厅大门外右侧为售票厅，左侧为出站口及公交场站。

站房总建筑面积3100多平方米，候车室面积约760平方米，最高聚集人数为600人。车站总体可分为上下2层，1层为候车厅、售票处及出站口；2层为站台层，站台布置方式为1个侧式站台（即1站台，南行列车停靠）和1个岛式站台（即2、3站台，北行列车停靠）。