叶坚纸质，披针形至线状披针形，长1.5～4.5厘米，宽0.5～1.2厘米，顶端钝，基部圆形，全缘，上面暗绿色，无毛或疏被贴生至开展的微柔毛，下面色较淡，无毛或沿中脉疏被微柔毛，密被下陷的腺点，侧脉4对，与中脉上面下陷下面凸出；叶柄短，长2毫米，腹凹背凸，被微柔毛。

花序在茎及枝上顶生，总状，长7～15厘米，常再于茎顶聚成圆锥花序；花梗长3毫米，与序轴均被微柔毛；苞片下部者似叶，上部者远较小，卵圆状披针形至披针形，长4～11毫米，近于无毛。花萼开花时长4毫米，盾片高1.5毫米，外面密被微柔毛，萼缘被疏柔毛，内面无毛，果时花萼长5毫米，有高4毫米的盾片。花冠紫、紫红至蓝色，长2.3～3厘米，外面密被具腺短柔毛，内面在囊状膨大处被短柔毛；冠筒近基部明显膝曲，中部径1.5毫米，至喉部宽达6毫米；冠檐2唇形，上唇盔状，先端微缺，下唇中裂片三角状卵圆形，宽7.5毫米，两侧裂片向上唇靠合。雄蕊4，稍露出，前对较长，具半药，退化半药不明显，后对较短，具全药，药室裂口具白色髯毛，背部具泡状毛；花丝扁平，中部以下前对在内侧后对在两侧被小疏柔毛。花柱细长，先端锐尖，微裂。花盘环状，高0.75毫米，前方稍增大，后方延伸成极短子房柄。子房褐色，无毛。

小坚果卵球形，高1.5毫米，径1毫米，黑褐色，具瘤，腹面近基部具果脐。花期7-8月，果期8-9月。

3 与黄芩有关的民间传说；李时珍生于明朝嘉靖年间，自幼聪明伶俐，好学上进，小小年纪就立志考取功名。光耀门庭。可是天有不测风云，在李时珍十、六岁时，他突患急病，咳嗽不止，并且久冶不愈。随着病情加剧，他每日吐痰碗余，烦、渴引饮，骨蒸劳热，六脉浮洪，虽服用柴胡、麦冬、荆芥、竹沥等解表退热、润肺清心、清热化痰之剂却并无效果。方圆百里的名医都束手无策，认为其已无药可救。眼看小时珍生命危在旦夕。