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REST工具软件的使用、BrainNet工具软件的使用

(2016-08-05 20:41:03)

分类：生物医学

针对fMRI数据进行分析。

一、matlab中键入rest回车，打开REST窗口。

1、进行双样本T检验

1）点击Statistical Analysis

2）打开下面窗口进行相关输入设置

 http://s2/bmiddle/002XIQaDzy73OKfTimJ41&690
http://s6/bmiddle/002XIQaDzy73OKyeHIx65&690matlab命令窗口中显示 Two Sapmle T Test Calculating...

.............................................................

Two Sample T Test Calculation finished.

计算后得到双样本t的结果t文件ttsample.nii。

2、对双样本T结果文件，进行展示分析：点击viewer

1）在打开的窗口中，导入ttsample.nii文件，结果如图所示

2）进行差异区域的查看，进行相关设置，如下图所示：
http://s6/bmiddle/002XIQaDzy73OMDD4Bn55&690

Misc的下拉箭头中可以进行颜色bar的设置。（默认的是64，可以自定）

3）点击CL.Report后，matlab中对差异脑区的具体情况进行相应计算，matlab命令窗口中查看具体结果。

4）点击Save Clusters 对所有脑区作为一个文件保存，命名difttsample.nii

5）点击montage ，对脑结构进行分层展示。可设置行，列，间隔毫秒数目。

二、matlab中键入BrainNet回车，打开BrainNet窗口

file-loadfile ，在窗口中进行相关设置

点击ok 。

进行差异脑区的脑结构立体展示。

注：对于脑结构网络图，可以导入相应的node，edge文件，进行脑结构节点图，和脑结构网络图的查看。

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