孙科公馆由上海华盖建筑事务所设计，建筑面积529平方米，使用面积335平方米。整个公馆为西洋风格，与铁道部的中国传统建筑风格形成鲜明对照。与民国时期的西式官邸相比，孙科公馆的设计也颇有个性。从楼房的正面看，左右不对称，正门左两层右三层，正门上方是阳台。正门呈拱形，有三重门，最外面是雕花铁门，后面是两重木门。楼顶的瓦既不是通常的大平瓦，也不是传统的小青瓦，而是中西结合的红色筒瓦和板瓦，一仰一合。公馆的后面还有一个露天喷水池。这些在民国公馆中是绝少见的。外墙呈乳黄色，与红色屋顶搭配极为和谐，鲜艳温暖。公馆会客厅、卧室、餐厅、浴室、卫生间齐备，装修也恰到好处，楼梯台阶用汉白玉砌造，木地板更是增添了温馨之感。