人类种系发生和演化过程中，随着食物种类的变化，带来咀嚼器官的退化，导致颌骨长度的减小，而牙齿数目却没有减少，两者之间就形成了不协调。下颌第三磨牙是最后萌出的牙齿，因萌出位置不足，可导致程度不同的阻生。阻生智齿及其萌出过程中，牙冠可部分或全部为牙龈覆盖，两者之间形成较深的盲袋，食物及细菌极易嵌塞于此处；加之冠部牙龈常因咀嚼食物而损伤，形成溃疡。当全身抵抗力低下、局部细菌毒力增强时，可引起冠周炎的急性发作。因此，智齿冠周炎主要发生在18~30岁智齿萌出期的青年人和伴有萌出不全阻生智齿的患者。