加权基因共表达网络分析课程 WGCNA

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WGCNA(加权基因共表达网络分析)利用基因表达数据,构建出加权的基因共表达网络,从而挖掘协同表达的基因模块,探索基因模块与性状之间的关系。该课程主要介绍WGCNA分析原理和对应的分析代码编写操作演示,通过实际的操作过程学会WGCNA分析。
WGCNA 原理介绍
- 关系矩阵介绍
- 邻接矩阵介绍
- TOM矩阵介绍
- 如何设定阈值确定最佳共表达网络
- 模块与样品性状联合分析
- 基因共表达网络可视化
- 基因共表达网络数据输出
WGCNA代码演示与讲解(上)
- 相关数据、WGCNA R包安装、路径设置
- 载入数据注意事项及相关分析
- 构建基因网络并建立模块
WGCNA代码演示与讲解(下)
- 模块与性状数据联合分析
- 基因网络可视化
- 基因网络数据输出
WGCNA代码要点与绘图
- 总结代码要点
- 利用Cytoscape绘制网络图
视频课程:WGCNA分析
WGCNA分析结果截图:
http://edu-image.nosdn.127.net/b1fff58c-54ea-4457-abf4-a842564fee8c.png图注:WGCNA
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