TALEN靶向基因敲除
标签:
教育 |
技术特点:
·无基因序列、细胞、物种限制。
·实验周期短。
·整个实验简单准确,成本低。
·成功率可达90%以上。
·毒性低、脱靶情况少。
·TAL的核酸识别单元与A、G、C、T有恒定的对应关系。
·靶序列识别模块不受上下游影响,特异识别并打断基因组中的任意靶序列。
·成对的TAL识别模块保证了基因敲除靶点的准确性。
·已经成功应用到了植物、细胞、酵母、斑马鱼及大、小鼠等各类研究对象。
基本原理与基因敲除步骤
步骤一
TAL的核酸识别单元为间隔32个恒定氨基酸序列的双连氨基酸。双连氨基酸与A、G、C、T有恒定的对应关系,即NI识别A,NG识别T,HD识别C,NN识别G,非常简单明确。因此,欲使TALEN特异识别某一核酸序列(靶点),只须按照靶点序列将相应TAL单元串联克隆即可。目前,TALEN系统利用FokI的内切酶活性打断目标基因。因FokI需形成2聚体方能发挥活性,在实际操作中需在目标基因中选择两处相邻(间隔17碱基)的靶序列(一般十几个碱基)分别进行TAL识别模块构建。
步骤二
靶点识别模块串接成功后需克隆入真核表达载体中。此真核表达载体含有TAL的其它必需结构域并在C端融合有FokI序列。
步骤三
TALEN质粒对共转入细胞后,其表达的融合蛋白即可分别找到其DNA靶位点并与靶位点特异结合。此时,两个TALEN融合蛋白中的FokI功能域形成二聚体,发挥非特异性内切酶活性,于两个靶位点之间打断目标基因。诱发DNA损伤修复机制。由于在此修过程中总是有一定的错误率存在。在修复中发生错误的个体即形成目标基因敲除突变体。
步骤四
利用实验设计时挑选的,位于相邻靶位点之间的特异性内切酶位点,可进行PCR产物酶切鉴定以筛选发生目标基因敲除的突变个体。

加载中…