HW平衡检验
(2016-12-13 17:19:24)| 分类: 分子水平的自然选择 |
HW平衡出现偏差的情况之——华伦德效应(Wahlund effect)
【实例】:
Navajo人群中MN等位基因符合HW平衡定律
Aborigine人群中MN等位基因符合HW平衡定律
若将这两种人群放在一起,会发现明显的杂合子观测值低于HW预测值。
造成这种杂合子缺失的原因是什么:
原因在于其违背了“随机交配”的条件:即Navajo人不大可能与Aborigine交配
这一理论被称之为华伦德效应,这种由于违背随机交配而造成的杂合子缺失现象通常出现在跨群体采样时。
为什么HW平衡非常重要?在对遗传病或者其他性状进行全基因组关联分析研究时,第一步就应该进行HW平衡检验,为什么?
如果某个SNP的等位基因频率在不同的群体间存在差异,且所研究的疾病发病率在两个群体间也存在差异,那么全基因组关联研究错误地使它看起来像是临近SNP的一个基因导致或参与
而如果进行HW平衡检验,你可以避免这一错误,因为你可以明确你是否在观察一个杂交群体。
你希望这一群体是符合HW平衡的,或者非常接近这一平衡,那么如果你看到某种关联,你才知道不是因为这种奇怪的偏差导致的。
所以:进行HW平衡检验是非常非常重要的!
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