用于计算机辅助有机合成（CAOS）的计算机软件用于有机化学和计算化学中，以促进设计和预测化学反应的任务。CAOS问题减少到识别一系列化学反应，这些化学反应可以从起始材料产生所需的目标分子。CAOS算法通常使用两个数据库：已知化学反应中的第一种和已知起始材料中的第二种（即，通常可商购的分子）。理想的合成计划成本较低，产率高，避免使用危险反应和中间体。通常作为规划问题，CAOS已经取得了重大进展。

下面列出了最通用的软件包的功能。

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• WODCA - 没有试用版; 专有软件
• 有机合成探索工具（OSET） - 开源软件
• CHIRON - 没有试用版; 专有软件
• SYLVIA - 演示版; 专有软件 ; 快速评估有机化合物的合成容易程度; 可以根据其合成复杂性优先考虑数千种结构（例如，通过从头设计实验生成或从大型虚拟化合物库中检索）
• ChemPlanner（前身为ARChem - Route Designer） - 是一个专家系统，帮助化学家为其目标分子设计可行的合成途径; 反应规则的知识库在算法上源自反应数据库，并且商业上可获得的起始材料用作反向合成搜索的终止点。
• ICSynth - 计算机辅助合成设计工具，使化学家能够生成目标分子的合成途径，以及多步交互式合成树; 其核心是转换库的算法化学知识库，它是从反应数据库自动生成的。
• Chematica
•  WODCA
• OSET
• CHIRON
• SYLVIA
• ChemPlanner
• ICSynth