杂交水稻种子的纯度与产量关系最大，是评价种子质量的主要依据。下面几种常用的种子纯度检验方法。

　　一是直观鉴别法。利用放大镜或肉眼直观检验样中的明显混杂粒。

　　二是利用谷较性状鉴别法。借助生物解剖镜观察种子粒形、谷壳表面纹路、毛多少、分布、夹持率等性状，以标准品种为对照进行鉴别；利用种子测微尺测千粒种子长宽计算平均每粒种子长宽比与标准品种对照可做为检验种子室内纯度的参考指标。

　　三是种苗鉴定法。在对品种真实性有疑或样品中可疑杂拉严重超标时进行，鉴定种苗应不少于1000粒（苗）。待苗生长至2叶1心时测量主根及芽的长粗，第1真叶长宽、并观察芽A色、叶形叶色，以标准品种做对照，综合考察鉴定。

　　四是仪器检定法。借用自动数粒仪可快速对水稻种子进行自动数粒，从而得知种子的千粒重，此方法操作简单，测量精准。