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Linux下VASP脚本的使用

(2012-08-02 11:05:18)
标签:

杂谈

分类: Vasp

Linux下VASP脚本的使用
文/有志者

 

在材料计算模拟软件VASP中,常常使用一些脚本来完成特定的简单任务。


脚本简介
无需编译,解释执行;文本文件形式存在;强大的正则表达式操作……


使用方法

 

1、VASP很多实用的脚本可从http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/ 下载vtstscripts,通过WinSCP上传到~/tools/vasptools/目录下;使用pwd命令拷贝出路径;
2、在根目录下(cd ~),使用ls -al命令查看,使用命令vi .bashrc,编辑以确保第一步目录在环境变量$PATH中,即在.bashrc文件末尾添加上
#-----------------------------------------------------------------------
# this is for vtstscripts 0.9; added by somebody
# Fri Oct 29 16:55:50 CST 2010
#-----------------------------------------------------------------------
export PATH=/home/gqzhang/tools/vasptools/vtstscripts:$PATH
3、在VASP工作目录下运行脚本,只要在工作目录下输入脚本名回车即可,如使用getcif.pl脚本,直接在工作目录下输入getcif.pl回车即可,运行结果会显示凭屏幕上,同时保存在out.cif文件中。多次test表示,有些目录可能因为路径太长而无法运行脚本,可将目录拷贝到其他较短路径的目录下。
4、拷贝out.cif文件到PC上,进行后续处理。

 

 

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