大报恩寺自发现宋代长干寺地宫，出土了佛顶骨舍利、感应舍利、玄奘顶骨舍利和诸圣舍利四份佛门至宝。它就声名海内外。

     舍利佛光佛厅里，有一座位于莲花座卧佛。背后五方佛宝相庄严。卧佛两侧各有一处菩提树。舍利佛光厅苍穹式的圆顶上，布满了42000琉璃灯，在玻璃面的反射下又呈现一倍数量，84000盏琉璃光亮对应佛法八万四千法门，而千万盏灯光变幻着颜色，庄严肃穆，美轮美奂。几棵菩提树上上挂着“八吉祥”，每盏莲花灯让人惊艳。

     佛像前的两棵树上是一盏盏精致的琉璃灯，寓意着菩提树和佛舍利的美好意境。

   琉璃灯配合佛音共变幻七种光芒，寓意着在大报恩寺的历史上曾出现过七次的舍利佛光。

汉文大藏经博物馆

    明清时期大报恩寺一直承担着全国绝大部分寺庙的印经任务，是当时中国佛经流通的中心，所刻印的汉文佛教大藏经，是汉文佛典的总集，其印制被视为功德无量的盛事。

   藏经阁里藏着唐三藏的经律论，十二部圣典世界堪称一绝。

   郑和后裔郑自海捐赠。明代周晖在《金陵琐事》记载：“五谷树有二株，一在皇城内，一在报恩寺，不但结子如五谷，亦有如鱼蟹之形者。乃三宝太监西洋取来之物。

五谷树

     五谷树的学名叫做“雪柳”。郑和远航回到南京，带回了不少植物，除了五谷树以外，还有沉香木、紫檀木、香木、婆罗树、西府海棠、詹卜花等。

       大报恩寺以现代工艺成就新塔古韵，成为南京的地标。

         南京大报恩寺为什么有名气，因为2008年7月17日，地宫被挖开，出土了一座七宝阿育王塔。藏有“感应舍利十颗，还供奉着释迦摩尼的佛顶真骨。此消息轰动了佛教界，更轰动了世界。

       2015年大报恩寺重新开放，为了保护地宫，新塔没有用琉璃，只采用钢结构和超白玻璃等轻质材料。

      周一到周五，每当夜晚来临，塔身发出单一颜色，周末发出七色彩灯。

      大报恩寺琉璃宝塔高达78.2米，通体用琉璃烧制，塔内外置长明灯一百四十六盏，是中世纪世界七大奇迹。清朝咸丰四年（1854年），大报恩寺塔被毁。

     生活于17世纪荷兰画家约翰·尼乌霍夫跟随使团访华的经历，他用画笔记录下画面。此书出版之后被译成多国语言，在欧洲影响甚大。书中以不小的篇幅描述了大报恩寺塔。记录了塔身红、黄、绿色相间的美妙色彩，塔檐下悬挂着的铃铛声响等等动人的细节。可惜，毁于太平天国的战火成为千古绝唱。

阿育王佛塔 

     此处地宫中挖掘出舍利、佛顶真骨。内用金棺,外以银椁,并鎏金七宝造成阿育王塔，以铁函及石涵安置。