耶利米哀歌的结构令圣经学者颇感兴趣。全书共有五章，亦即五首抒情诗，头四首是离合体，每句起头均依次以希伯来文22个字母开始。另一方面，第三章则共有66节，因此每段连续3节都以相同的字母开始，然后才以另一个字母开始，依次顺序下去。第五首诗歌虽然也有22节，体裁却并非离合体。

“先前满有人民的城，现在何竟独坐！”这是第一首诗歌的首句。锡安的女儿虽曾贵为公主，现在她的爱人竟把她抛弃，她的百姓则流亡异域。她的城门荒废。耶和华因她罪孽深重而刑罚她，使她威荣尽失。敌人因她倾倒而嗤笑她。她的败落叫人惊讶，无人安慰她，余下的居民食不果腹。她（人格化的耶路撒冷）问道：“有像这临到我的痛苦没有？”她举起双手说：“耶和华是公义的！他这样待我，是因我违背他的命令。”她恳求耶和华降祸与那些趾高气扬的仇敌，正如上帝待她一般。

“主（耶和华）何竟发怒，使黑云遮蔽锡安城！”（耶利米哀歌2：1）第二首诗歌表明是耶和华亲自将以色列的华美扔在地上的。他使节期和安息日被人遗忘，他丢弃自己的祭坛和圣所。耶路撒冷的惨况令人不忍卒睹。耶利米呼喊道：“我眼中流泪，以致失明；我的心肠扰乱，肝胆涂地，都因我众民遭毁灭。”（耶利米哀歌2：11）他将耶路撒冷的女儿比作什么，他怎样安慰锡安的女儿，她的预言者都一筹莫展。现在凡过路的都嗤笑说：“难道人所称为全美的，称为全地所喜悦的，就是这城吗？”（耶利米哀歌2：15）她的仇敌都向她大大张口，又嗤笑，又切齿，说：‘这真是我们所盼望的，吞灭她的日子临到了。’她的孩童饿得发昏，妇人吃自己所生的孩子。街上满了死尸。“耶和华发怒的日子，无人逃脱，无人存留。”（耶利米哀歌2：16，22）

第三首诗歌共有66节，强调锡安要仰望上帝的怜悯。耶利米以许多比喻指出是耶和华定意使他们被掳和遭受荒凉的。执笔者在困苦的境况下哀求耶和华记念他的苦情，并表示对耶和华的慈爱和怜悯满怀信心。其中连续有三节经文均以“这原是好的”为开始，并表明应当等候耶和华的救恩。耶和华虽使人忧愁，却仍会施怜悯。但是目前，即使他们承认犯罪悖逆，耶和华仍不赦免；他挡住百姓的祷告，使之成为“污秽和渣滓”。（耶利米哀歌3：45）预言者眼泪成河，并说他的仇敌追逼他像追雀鸟一样。然而，耶和华在深牢中临近他说：“不要惧怕！”他求耶和华向仇敌的辱骂施行报应，说：“你要发怒追赶他们，从耶和华的天下除灭他们。”（耶利米哀歌3：57，66）

“黄金何其失光！纯金何其变色！”（耶利米哀歌4：1）第四首诗歌哀叹耶和华的圣殿何竟荣耀尽失，其上的石头竟倒散在街上。锡安宝贵的众子已变得毫无价值，就像泥造的瓦瓶一样。城中无水无饼，素来鲜衣美食的人如今却要“躺卧粪堆”。（耶利米哀歌4：5）所受的惩罚比所多玛的罪所受的还大。锡安的贵胄素来“比雪纯净，比奶更白”，现在却“比煤炭更黑”，干瘪如同槁木。（耶利米哀歌4：7，8）饿死的不如被刀杀的，当时的妇人竟亲手烹煮自己的儿女作食物。耶和华倾倒他的烈怒。难以置信的事终于发生了——敌人竟闯进了耶路撒冷的城门，“这都因她先知的罪恶和祭司的罪孽”，他们流了义人的血。（耶利米哀歌4：13）耶和华的脸并非朝着他们。然而，锡安的女儿的罪愆止息了，她不再被掳到异地去了。现在该轮到以东的女儿遭殃了，她要喝下耶和华的苦杯。

第五首诗歌一开始便恳求耶和华记念他那有如孤儿般的子民。耶利米描述耶路撒冷的居民如此说，他们的列祖犯了罪，如今他们却要担当列祖的罪孽。奴仆辖制他们，他们饥肠辘辘。他们心中的快乐止息，跳舞变为悲哀。他们心里发昏。他们遂谦卑地向耶和华承认：“耶和华啊，你存到永远；你的宝座存到万代。”他们呼求说：“耶和华啊，求你使我们向你回转，我们便得回转。求你复新我们的日子，像古时一样。你竟全然弃绝我们，向我们大发烈怒？”