OR值的全称是odd ratio, 又称比值比，对于发病率很低的疾病来说，它是OR值即是相对危险度的精确估计值。

计算公式如下：

Odd ratio, 95% CI

假定我们要鉴别一个基因（或者标记位点SNP）有两个等位基因（等位）:记为

odds 值在病例和对照可以计算如下：

病例Allele 1 Odds  = ^{A (A + B)}/ _{B (A + B)} = ^A / _B

对照Allele 1 Odds  = ^{C (C + D)} / _{D (C + D)} = ^C / _D  

那么在这一点Allele 1的OR值可以计算如下：

    Odds Ratio = ^{(A / B)}/_{(C / D)} = ^{A D}/ _{B C}

同样的，95% Confidence Intervals (CIs) 值可以计算如下：

95% CI of ln(OR) = ln(OR)±1.96(¹/_A + ¹/_B + ¹/_C + ¹/_D)^0.5

95% CI of OR = e^{95% CI of ln(OR)、}

logistic回归中，OR值=1，表示该因素对疾病的发生不起作用
                    OR值大于1，表示该因素是一个危险因素
                    OR值小于1，表示该因素是一个保护因素

      ^{同时最好要算出它的95%CI}

      ^{OR为比值比，也称优势比
      当我们已知疾病的发生状况，比较疾病组与非疾病组危险因素暴露的情况差异时（即回顾性研究时），用OR进行定量描述。OR是否有意义还要看其P值，一般95%CI 上限小于1时说明可能是保护因素，相反如果下限大于1则说明可能是危险因素。}

ln(OR)近似服从正态分布，因此在计算OR值置信区间的时候都是先计算ln(OR)置信区间，再计算OR置信区间（参考：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1127651/， http://bioterrorism.slu.edu/bt/products/bio_epi/scripts/mod12.pdf，http://www.sjsu.edu/faculty/gerstman/StatPrimer/case-control.pdf）

^{参考资料1（维基）：http://en.wikipedia.org/wiki/Odds_ratio#}

定义：Definition in terms of group-wise odds

If the probabilities of the event in each of the groups are p₁ (first group) and p₂ (second group), then the odds ratio is:

where q_x = 1 − p_x. An odds ratio of 1 indicates that the condition or event under study is equally likely to occur in both groups.

参考资料2：http://www.bioinformatics.org/snp-tools-excel/

例子1：

http://s9/middle/4af3f0d2gb2384f522538&690CI" TITLE="[转载]OR值的意义和计算公式，和95% CI" />

例子2：

http://s6/middle/4af3f0d2gb238544af855&690CI" TITLE="[转载]OR值的意义和计算公式，和95% CI" />

参考资料3：blackwell出版社

http://www.blackwellpublishing.com/specialarticles/jcn_10_268.pdf

参考资料4：http://intmedweb.wfubmc.edu/ebmreviews/odds.html

参考资料6 ：http://stanford.edu/class/gene210/files/writeups/gwas-howto-2.pdf

参考资料7:  http://www.statsdirect.com/help/exact_tests_on_counts/gart.htm （介绍了OR和RR区别和联系）