XY型的性别决定中，X和Y在不同的生物中所起的作用是不同的。有以下几种： 
（1）在哺乳动物的性别决定中，X染色体和Y染色体所起作用是不等的。Y染色体的短臂上一个“睾丸决定”基因，有决定“男性”的强烈作用；而X染色体几乎不起作用。合子中只要有Y就发育成雄性；仅有X染色体（OX）则发育成雌性。那么XXY发育成雄性。 
（2）对于果蝇来说，Y染色体上没有决定性别的基因，在性别决定中失去了作用。X是雌性的决定者。正常情况下XX表现为雌性，而XY表现为雄性。染色体异常形成的性染色体组成为XO的果蝇发育为雄性但不育.，而性染色体为XXY的果蝇则发育为雌性。 
由此可见果蝇性别决定与人的性别决定比较与人类明显不同：人类：凡有Y不管X数目多少均为♂，人类中XXY是男性，而X0 则发育成女性。果蝇：性别由X染色体数目与常染色体组数之比决定，与Y无关。果蝇中性染色体异常的XXY为雌性，而X比较少的0X则发育成雄性。