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06.Evolview:设置分组标签

(2016-08-22 14:15:04)
标签:

evolview

进化树

注释

分类: Evolview进化树注释

1.1 设置方法

[1].   使用进化树“(chicken,((mouse,rat),(chimp,human)));

[2].   点击Annotation upload upload data for group label

http://s9/mw690/002AR4Npzy74fqlaW7e28&690

[3].   data文本框输入命令“chicken text=cute by itself”并提交

[4].   结果展示

http://s1/mw690/002AR4Npzy74fqmqXhS50&690

1.2 命令格式说明

设置语句含2列,制表符分隔。以“chicken text=cute by itself,color=red”为例,

l  1列:可以是一个叶节点,或者由逗号分隔的2个叶节点

l  2列:设置文字标签(text=label,必须)和格式参数(color=可选)

格式参数有2种设置方式

l  一是全局参数,以“!groupLabel”起始,放在第一行,作用于所有语句

l  二是局部参数,像上文这样放置在每条语句后,只作用于当前语句;局部参数会覆盖全局参数。

格式参数列表

参数

功能

参数取值与说明

show=1

显示或隐藏分组标签

取值为 0 (隐藏) 1(显示);默认为1(不知为何,这个参数怎么设置结果都没有变化,好在不设置也没影响)

style=1

设置分组标签的显示方式

取值为[1,2,3,4,5]中的一个;默认为1环形视图模式下,style=4style=5效果相同

color=red

设置分组线条和标签的颜色

取值为颜色的英文名称或16进制代码;默认为黑色

linewidth=2

设置分组线条的宽度

取值为0或整数;设为0时分组线条将隐藏;默认为1仅在style=1时可用

linestyle=dashed

指定分组线条为虚线

默认为实线;仅在style=1时可用

fontcolor=black

设置分组标签的颜色

取值为颜色的英文名称或16进制代码;默认为黑色;如果没设置,则使用color的设置

fontsize=12

设置分组标签的字体字号

取值为任意整数;默认为 10

fontitalic=1

设置分组标签的字体倾斜

取值为0(不倾斜)或1(倾斜);默认为0

textalign=middle

设置分组标签的对齐方式

取值为[start,middle, end]中的一个,默认为middle

textorientation=horizontal

设置分组标签相对叶子标签的方向

取值为[horizontal,vertical]中的一个;默认为horizontal

bkcolor=colorname

设置分组标签的背景色

取值为颜色的英文名称或16进制代码;默认为lightblue(浅蓝色);仅在style=2~5时可用

marginPCT=0.05

设置分组标签之间的留白

取值为01之间的小数;默认为0.05;取值越大,分组标签之间的空白越大

 

1.3 命令示例

[1].   只设置分组标签

http://s4/bmiddle/002AR4Npzy74fqrMC7903&690

http://s8/bmiddle/002AR4Npzy74fqtLOd1c7&690

[2].   设置分组标签之间的留白(marginPCT=0.8

http://s12/bmiddle/002AR4Npzy74fqvB2Mr0b&690

http://s8/bmiddle/002AR4Npzy74fqwR9Qja7&690

[3].   设置分组标签的线条的颜色(color=red

http://s9/bmiddle/002AR4Npzy74fqxWTjy58&690

http://s9/small/002AR4Npzy74fqA7DQIe8&690

[4].   设置分组标签的颜色(fontcolor=#0000FF

http://s4/bmiddle/002AR4Npzy74fqT02xt13&690

http://s7/bmiddle/002AR4Npzy74fqCKIvAc6&690

[5].   设置分组标签的字号和倾斜(fontsize=20,fontitalic=1

http://s12/bmiddle/002AR4Npzy74fqXHcFl0b&690

http://s7/small/002AR4Npzy74fqYrBVcd6&690

[6].   设置分组标签的对齐方式(textalign=start end or middle

textalign=start

http://s12/bmiddle/002AR4Npzy74fr95JaP1b&690

textalign=middle

http://s5/bmiddle/002AR4Npzy74fracaoca4&690

textalign=end

http://s14/bmiddle/002AR4Npzy74frb2xJj7d&690

[7].   设置分组标签相对叶子标签的方向(textorientation=horizontal/vertical)。需要点击“Basic à View tree as circular cladogram”将进化树设置为环形视图。不然竖直方向的分组标签会重叠在一起。

http://s8/bmiddle/002AR4Npzy74frcpB0r07&690

textorientation=horizontal

http://s9/bmiddle/002AR4Npzy74fre07Ucf8&690

 

textorientation=vertical

http://s4/bmiddle/002AR4Npzy74frgbVeP83&690

 

[8].   设置分组线条的宽度(linewidth=10

http://s14/bmiddle/002AR4Npzy74frsOhYh6d&690

[9].   将分组线条设置为虚线(linestyle=dashed

http://s7/bmiddle/002AR4Npzy74frtt0r4d6&690

[10].             设置分组标签的显示方式

http://s7/bmiddle/002AR4Npzy74fruYcu2d6&690

http://s4/bmiddle/002AR4Npzy74frvExSbb3&690

http://s15/bmiddle/002AR4Npzy74frwK4lo2e&690

http://s3/bmiddle/002AR4Npzy74frB9FpE42&690

http://s1/bmiddle/002AR4Npzy74frBXoY0c0&690

http://s5/bmiddle/002AR4Npzy74frD2W4Qd4&690

http://s16/bmiddle/002AR4Npzy74frEtz55bf&690

http://s4/bmiddle/002AR4Npzy74frFhqbp93&690

http://s8/bmiddle/002AR4Npzy74frGeGfJ07&690

http://s8/bmiddle/002AR4Npzy74frJjUNN87&690

http://s3/bmiddle/002AR4Npzy74frLxKN4e2&690

http://s11/bmiddle/002AR4Npzy74frMfAFQ9a&690

 

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