加载中…VMD中如何改变原子颜色(原创)
(2017-01-18 13:37:15)
VMD导入Gaussain的cube文件后，由于cube文件中原子类型是原子序号而非原子名称。
VMD中原子名称和类型的选择只认字符不认数字
可采用以下方法处理：
1.
VMD=>Graphics=>Representations=>Create Rep
新建一个Representation，并将Drawing Method设为CPK。
2.
在VMD=>Graphics=>Representations=>Selections标签下，Keyword选element，Value选Au(你导入Cube文件时其中的某个原子)，然后点Apply。
3.
在VMD=>Graphics=>Representations=>Draw Style标签下，Coloring
Method设置Color ID，如选择14(ochre)
4. 类似地，可以设Ag原子为Color ID
6(silver)。
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