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蛋白质中的金属离子

(2014-03-03 19:38:12)
标签:

离子通道

金属

蛋白质

氨基酸

识别

目前Swiss-prot 等蛋白质数据库PDB里的蛋白质,有三分之一的蛋白质需要与金属离子结合发挥功能。

 

比如血红蛋白和肌球蛋白都会结合Fe2+ 铁离子。

 

我认为蛋白质与金属离子的相互作用还存在其它形式,比如离子通道(钾,钠,钙)等蛋白的相互识别,还有某些蛋白对重金属离子的吸附作用等。

 

比如CPTEE (一个半胱氨酸,然后两个随机氨基酸,然后两个谷氨酸)这个序列可以吸附铅离子Pb (参考文献:Surface Display of Metal Fixation Motifs of Bacterial P1-Type ATPases Specifically Promotes Biosorption of Pb2+ by Saccharomyces cerevisiae

TVGYG是钾离子通道的选择性氨基酸序列,识别钾离子。

GXXCXXC 可以转移铅,锌,镉。参考:The cysteine-rich amino-terminal domain of ZntA, a Pb(II)/Zn(II)/Cd(II)-translocating ATPase from Escherichia coli, is not essential for its function

参考:

Prediction of Metal Ion–Binding Sites in Proteins Using the Fragment Transformation Method

 

http://www.juit.ac.in/attachments/Metallopred/prediction.html

 

MetalMine: A database of transition metal-binding sites in proteins

 

Recognition of Metal Ion Binding Proteins    By Edwin Jose Palathinkal


在google搜索"P1-Type ATP  Metal binding motif Pb"

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