R软件包学习之RColorBrewer_fanyucai

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R软件包学习之RColorBrewer

(2016-06-23 16:35:18)

分类： R语言与数理统计

1:软件包安装：

install.packages("RColorBrewer")

2:这个包把颜色分成三种类型：

1. Sequential（范围：3-9）

Blues BuGn BuPu GnBu Greens Greys Oranges OrRd PuBu PuBuGn PuRd Purples RdPu Reds YlGn YlGnBu YlOrBr YlOrRd

2. Diverging（范围：3-11）

BrBG PiYG PRGn PuOr RdBu RdGy RdYlBu RdYlGn Spectral

3:Qualitative（后面的数字代表最大颜色种类范围）

Accent 8

Dark2 8

Paired 12

Paste1 9

Paste1 8

Set1 9

Set2 8

Set3 12

4：RColorBrewer palette chart

5:使用举例：

library(RColorBrewer)

mypalette<-brewer.pal(9,"Reds")#这里数字9是颜色的最大值，一般是最小为3，最大值根据不同颜色确定

library(LDheatmap)

LDheatmap(GIMAP5.CEU$snp.data,GIMAP5.CEU$snp.support$Position,color = (mypalette))

＃图形颜色默认是从深到浅，但是有时候需要由浅到深，可以将上面的语句更改为（color=rev(mypalette )）

画出来的图形分别为：

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