1:变异检测：10-30x(SNP\InDel>10X,SV>20X,CNV>30,转座子>20X)

2:简化基因组测序技术（GBS）：其原理是将基因组DNA进行酶切，然后酶切片断两端序列进行高通量测序，通常捕获全基因组约1%的序列。

3:当测序深度为5X以上时，个体基因组覆盖度约90%，能检测到的个体SNP数约60%。当测序深度为10X以上时，个体对基因组覆盖度约为95%能检测到的个体SNP数约为90%。对于较大群体（如GWAS项目）在进行SNP检测时低深度数据可进行缺失推断以及个体间存在弥补效应，建议测序深度不低于5X。