基因组组装kmer的选择（kmergenie）_fanyucai

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基因组组装kmer的选择（kmergenie）

(2015-06-04 18:15:37)

分类：生物信息学

软件首页：http://kmergenie.bx.psu.edu

使用说明：

1:对于single read文件，可以使用以下命令：

./kmergenie single_reads.fastq

2:对于双端reads或者多个文库，建立文本文件list,然后运行：

/share/nas21/fanyc/testing/assembly_test/out/qc/erro/correct.0.fq

/share/nas21/fanyc/testing/assembly_test/out/qc/erro/correct.1.fq

3:./kmergenie list_reads

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