加载中…Cytoscape与网络可视化
(2017-03-04 20:59:41) | 分类： 生物信息学 |
1、Java环境安装：
若无JRE，Cytoscape将无法正常安装、运行、卸载
64位计算机可安装64位（x64）或32位（i586)JRE，32位计算机只能安装32位JRE
2、cytoscape安装
支持Windows、mac OS、Linux
64位安装包对应64位JRE，32位安装包对应32位JRE
如果如法安装cytoscape，请检查cytoscape64位是否对应Java64位环境，否则cytoscape无法安装。
http://s3/mw690/002o29i7zy79fiKqbCOa2&690
3、Cytoscape操作
在可视化区域右键
选择Add-Node
新建四个节点
左键单击选择一个节点
Ctrl+单击选择多个节点
右键单击，Add-Edges Connecting Selected Nodes
用边连接选中的节点
选择节点
右键单击，编辑节点造型，选择Edit
对选中节点进行设置，点击Bypass Style，Set Bypass to Selected Nodes
http://s6/mw690/002o29i7zy79fjF0xUxa5&690
选择边
右键单击，编辑边造型，选择Edit
对选中节点进行设置，点击Bypass Style，Set Bypass to Selected Edges
方法1：Ctrl+N建立子网络
方法2：File-New-Network-From selected nodes, all edges
方法3：点击工具栏New network from selection
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