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RAD测序

(2012-06-07 14:49:41)
标签:

rad测序

简化基因组测序

杂谈

分类: 技术服务

RAD(Restriction-site associated DNA tags)测序,作为一种简化基因组测序技术,首先利用限制性核酸内切酶识别基因组相关位点并进行酶切反应,然后对酶切获得的Tag序列进行高通量测序。该方法能够显著降低基因组的复杂度,快速、经济地鉴定出成千上万个单核苷酸多态性(SNPs)标记。

 应用范围

1、分子标记的开发

2、超高密度遗传图谱的构建

3、群体遗传分析

 技术优势

1、所需测序量低,价格便宜      

2、可检测更多样本

3、参考基因组不依赖性

 技术路线

 

 

http://s3/bmiddle/80d2d9fdhc1dc6c6acd52&690



 生物信息分析

1、分子标记开发

个体SNPs的鉴定,个体InDel标记的鉴定,群体SNPs标记的整合。

2、超高密度遗传图谱构建

连锁群的区分,海量标记的排序,偏分离位点的筛选。

3、群体遗传分析

对SNPs数据进行群体遗传学水平分析,包括Tree,群体结构分析,PCA分析等。

4、基因组草图绘制

基因组草图的组装,基因注释等。

 美吉优势

1、承诺图谱密度指标、标记个数
2、可以做四倍体物种的高密度SNP标记遗传图谱
3、提供图谱总遗传距离,负责客户性状定位工作
4、提供客户文章写作方法部分文字、项目相关表格和图片。
5、灵活的价格策略

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