RAD测序

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rad测序简化基因组测序杂谈 |
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RAD(Restriction-site associated DNA tags)测序,作为一种简化基因组测序技术,首先利用限制性核酸内切酶识别基因组相关位点并进行酶切反应,然后对酶切获得的Tag序列进行高通量测序。该方法能够显著降低基因组的复杂度,快速、经济地鉴定出成千上万个单核苷酸多态性(SNPs)标记。
1、分子标记的开发
2、超高密度遗传图谱的构建
3、群体遗传分析
1、所需测序量低,价格便宜
2、可检测更多样本
3、参考基因组不依赖性
http://s3/bmiddle/80d2d9fdhc1dc6c6acd52&690
1、分子标记开发
个体SNPs的鉴定,个体InDel标记的鉴定,群体SNPs标记的整合。
2、超高密度遗传图谱构建
连锁群的区分,海量标记的排序,偏分离位点的筛选。
3、群体遗传分析
对SNPs数据进行群体遗传学水平分析,包括Tree,群体结构分析,PCA分析等。
4、基因组草图绘制
基因组草图的组装,基因注释等。
1、承诺图谱密度指标、标记个数
2、可以做四倍体物种的高密度SNP标记遗传图谱
3、提供图谱总遗传距离,负责客户性状定位工作
4、提供客户文章写作方法部分文字、项目相关表格和图片。
5、灵活的价格策略